| 向日葵锈菌弹性金属蛋白酶基因克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李鑫淳,宋阳,路妍,景岚.向日葵锈菌弹性金属蛋白酶基因克隆及生物信息学分析[J].华北农学报,2019,34(3). |
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| 作者姓名： | 李鑫淳 宋阳 路妍 景岚 |
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| 作者单位： | 内蒙古农业大学农学院,内蒙古呼和浩特,010019;内蒙古农业大学农学院,内蒙古呼和浩特,010019;内蒙古农业大学农学院,内蒙古呼和浩特,010019;内蒙古农业大学农学院,内蒙古呼和浩特,010019 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家向日葵现代产业技术体系建设项目 |
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| 摘 要： | 为了研究向日葵锈病的致病机制,将向日葵锈菌转录组中表达量较高的一个基因(KU994904)中成熟部分进行生物信息学分析及基因克隆。利用Interpro对蛋白ORF区域进行分析,确定其成熟区域,通过生物信息学相关软件对其进行结构预测及预测分析,从向日葵锈菌中提取总RNA,并利用RT-PCR方法扩增此蛋白酶成熟基因并克隆。结果显示:该蛋白酶成熟基因序列全长1 335 bp,编码445个氨基酸,分子质量49.5 ku,其与M36家族中5条序列具有较高相似性,并发现同胞外金属蛋白酶基因序列相似度达到53.77%。因此,推断其为弹性金属蛋白酶。
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| 关 键 词： | 向日葵锈菌 弹性金属蛋白酶 克隆 生物信息学分析 |
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