| 马铃薯StNF-Y核转录因子基因的克隆和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 史丽,吴亚茹,王晓娟,常燕楠,庞鹏湘,郜刚.马铃薯StNF-Y核转录因子基因的克隆和生物信息学分析[J].华北农学报,2019,34(3). |
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| 作者姓名： | 史丽 吴亚茹 王晓娟 常燕楠 庞鹏湘 郜刚 |
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| 作者单位： | 山西师范大学生命科学学院,山西临汾,041000;山西师范大学生命科学学院,山西临汾,041000;山西师范大学生命科学学院,山西临汾,041000;山西师范大学生命科学学院,山西临汾,041000;山西师范大学生命科学学院,山西临汾,041000;山西师范大学生命科学学院,山西临汾,041000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 为了研究马铃薯StNF-Y基因在非生物逆境中的作用与功能,在马铃薯抗青枯病基因型ED13中克隆了1个新的NF-YC转录因子(StNF-Y),并对其进行生物信息学分析,预测其生物学功能。结果表明,StNF-Y基因的全长cDNA为1 132 bp,其开放阅读框为693 bp,编码230个氨基酸,氨基酸分子式为C_(1112)H_(1735)N_(317)O_(339)S_(10),等电点为5.37,含有13个磷酸化位点;StNF-Y蛋白分布在胞质中,无信号肽,属于亲水性蛋白,含有高度保守的结构域,属于BUR6 superfamily家族;二级结构显示,StNF-Y蛋白主要由45.65%的α-螺旋、5.65%的延伸链、45.22%的无规则卷曲和3.48%的β-转角组成。系统进化分析结果显示,马铃薯StNF-Y序列与番茄、辣椒和烟草NF-YC序列亲缘关系较近。此外,StNF-Y在多种植物胁迫中起作用。因此,推测StNF-Y可能参与马铃薯相关胁迫抗性的调节。研究结果可为以后进一步深入研究马铃薯StNF-Y的功能以及对逆境胁迫的抵抗机制提供理论依据。
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| 关 键 词： | 马铃薯 StNF-Y 生物信息学 电子克隆 |
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