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企鹅源禽1型副黏病毒基因组序列分析
引用本文:施少华,黄瑜,程龙飞,傅光华,陈红梅,陈珍,苏敬良.企鹅源禽1型副黏病毒基因组序列分析[J].中国家禽,2009,31(16).
作者姓名:施少华  黄瑜  程龙飞  傅光华  陈红梅  陈珍  苏敬良
作者单位:1. 福建省农科院畜牧兽医研究所,福建福州,350013;福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心,福建福州,350013
2. 福建省农科院畜牧兽医研究所,福建福州,350013
3. 中国农业大学动物医学院,北京,100093
基金项目:国家自然科学基金项目,福建省科技重大专项-水禽副粘病毒诊断技术研究子课题、福建省财政专项-福建省农科院科技创新团队建设基金 
摘    要:为了从分子水平上探讨企鹅源禽1型副黏病毒BP01的演化,根据GenBank登录的鹅源禽1型副黏病毒基因序列设计引物,运用RT-PCR方法于国内外首次测定了企鹅源禽1型副黏病毒全基因组序列,其全长为15 192nt.经分析表明BP01病毒基因组与SF02株和ZJ1株等鹅源禽1型副黏病毒同源性最高,分别为99.1%和99.0%;与IT-227/82和dove/Italy/2736/00等鸽源禽1型副黏病毒同源性分别为90.2%和88.1%;而与Hert/33和LaSota等鸡源禽1型副黏病毒的同源性最低,仅分别为87.9%/和83.2%.对F基因第47~435nt进行系统进化树分析和F基因第334~1 682 nt进行HinfⅠ、BstO Ⅰ、Rsa Ⅰ酶切位点分析,确定BP01株病毒为基因Ⅶ型.F蛋白裂解位点氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F117,符合禽1型副黏病毒强毒株的特性,经预测发现BP01株病毒F蛋白的七肽重复序列分剐在第143~189位氨基酸残基和第461~503位氨基酸.通过对主要毒力基因推导的氨基酸序列进行比较发现,水禽源与其它源F蛋白有14个氨基酸不同,HN蛋白上有2个氨基酸的不同,而P蛋白有20个氨基酸的不同,且在第151~166位氨基酸存在一个明显的突变域.

关 键 词:企鹅  禽1型副黏病毒  全基因组  序列测定  功能基因分析

Sequence Analysis of Complete Genome of Avian Paramyxovirus-1 Isolated from Penguin
SHI Shaohua,HUANG Yu,CHENG Longfei,FU Guanghua,CHEN Hongmei,CHEN Zhen,SU Jingliang.Sequence Analysis of Complete Genome of Avian Paramyxovirus-1 Isolated from Penguin[J].China Poultry,2009,31(16).
Authors:SHI Shaohua  HUANG Yu  CHENG Longfei  FU Guanghua  CHEN Hongmei  CHEN Zhen  SU Jingliang
Abstract:
Keywords:
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