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水牛DDR1基因生物信息学及细胞学功能分析
引用本文:陆杏蓉,段安琴,邓廷贤,马小娅,杨春艳,郑海英,冯超,黄晨茜,尚江华.水牛DDR1基因生物信息学及细胞学功能分析[J].黑龙江畜牧兽医,2023(9):48-53+130-131.
作者姓名:陆杏蓉  段安琴  邓廷贤  马小娅  杨春艳  郑海英  冯超  黄晨茜  尚江华
作者单位:中国农业科学院广西水牛研究所农业农村部水牛遗传繁育技术重点实验室/广西水牛遗传繁育重点实验室
摘    要:为了了解水牛DDR1蛋白的生物信息学和细胞学功能,试验采用ProtParam、ProtScale、SOPMA、SWISS-MODEL、PSORTⅡPredictio、NetPhos 3.1在线软件对水牛DDR1蛋白进行生物信息学分析,采用基因干扰的方法研究水牛DDR1基因对水牛乳腺上皮细胞增殖、凋亡、基因表达和迁移的影响。结果表明:水牛DDR1蛋白由915个氨基酸组成,分子式为C4538H7029N1261O1287S43,分子量为101 222.99 u,半衰期为30 h,理论等电点为6.22,属于酸性、不稳定、可溶性蛋白质。DDR1蛋白的二级结构由256个α-螺旋(27.98%)、175个延伸链(19.13%)、55个β-折叠(6.01%)、429个无规则卷曲(46.89%)构成。亚细胞定位于内质网(44.4%)、高尔基体(33.3%)和质膜中(22.2%)中。DDR1蛋白共含有65个磷酸化位点,其中丝氨酸磷酸化位点35个,苏氨酸磷酸化位点18个,酪氨酸磷酸化位点12个。D...

关 键 词:DDR1基因  生物信息学  分析  乳腺上皮细胞  增殖  凋亡  迁移
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