盐胁迫下玉米WRKY转录因子生信及表达分析 |
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引用本文: | 冯艳飞,刘丽滨,任国鑫,李聪,李志芳,孙丽芳,高树仁.盐胁迫下玉米WRKY转录因子生信及表达分析[J].玉米科学,2023,31(5):17-24. |
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作者姓名: | 冯艳飞 刘丽滨 任国鑫 李聪 李志芳 孙丽芳 高树仁 |
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作者单位: | 黑龙江八一农垦大学农学院/黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室, 黑龙江 大庆 163319 |
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摘 要: | WRKY是一类在逆境胁迫响应中起重要调控作用的转录因子。基于盐胁迫下的玉米转录组数据,确定了16个差异表达的WRKY基因家族成员。利用生物信息学方法对各成员理化性质、染色体分布、蛋白保守结构域、系统进化、顺式作用元件及盐胁迫下的相对表达量进行分析验证。结果表明,16个差异表达的WRKY基因家族成员主要分布在玉米的7条染色体上,各成员之间理化性质存在差异。qRT-PCR 验证结果表明,不同基因家族成员对盐胁迫的敏感程度不同,对胁迫处理时间的响应也有所不同。ZmWRKY106、ZmWRKY108、ZmWRKY91、ZmWRKY27在盐胁迫后24 h内均未参与表达,经盐胁迫处理6 h后ZmWRKY63表达量达到最高。各家族成员对盐胁迫的响应及敏感程度不同,可能与各成员间理化性质和结构的差异以及所含的顺式作用元件、内含子和motif类型有关。
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关 键 词: | 玉米 WRKY转录因子 盐胁迫 生信分析 表达模式 |
收稿时间: | 2022/5/22 0:00:00 |
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