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猪瘟流行毒E2基因部分编码序列的分析与比较
引用本文:涂宜强,李晓成,杨增歧,徐辉,陈杰,吴发兴,黄保续.猪瘟流行毒E2基因部分编码序列的分析与比较[J].中国动物检疫,2005,22(7):23-26.
作者姓名:涂宜强  李晓成  杨增歧  徐辉  陈杰  吴发兴  黄保续
作者单位:1. 西北农林科技大学动物科技学院,陕西,杨凌,712100
2. 农业部动物检疫所,青岛,266032
摘    要:利用PCT-PCR方法获得16个猪瘟流行毒株、5株弱毒疫苗株和外来的4株猪瘟E2基因部分编码序列的扩增片断,并对其进行测序,获得659bp含E2基因N段A、B、C、D四区域的编码序列。利用DNAstar软件对其中616bp的片段进行序列分析,并与Genebank中的Alfort、Brescia、HCLV、Shimen等毒株进行比较.结果20株病毒所测序列均为猪瘟E2基因序列,所有毒株碱基替换随机分布于整个序列.部分毒株出现碱基缺失现象。序列分析结果表明近期流行的毒株不仅与50年代流行的Shimen株、现用的疫苗株距离较远,而且流行毒株呈不同亚群方向演变。本研究所测的20株流行株E2基因N端6个与C端的2个半胱氨酸(Cys)均未发生变异.但其他位点的核甘酸变异与缺失.引起各区的抗原表位呈现不同程度的变异。

关 键 词:E2基因  编码序列  猪瘟  流行毒株  PCR方法  弱毒疫苗株  序列分析  HCLV  基因序列  随机分布  50年代  分析结果  抗原表位  半胱氨酸  变异  核甘酸  流行株  研究所  缺失  碱基  病毒  行比  亚群  位点
文章编号:1005-944X(2005)07-0023-04

Sequence Analysis and Comparison of the Partical Coding Sequence of 25 Hog Cholera Virus Strains E2 gene
Tu YiQiang,Li XiaoCheng,Yang ZengQi,Xu Hui,Cheng Jie,Wu FaXin,Huang BaoXu.Sequence Analysis and Comparison of the Partical Coding Sequence of 25 Hog Cholera Virus Strains E2 gene[J].China Journal Of Animal Quarantine,2005,22(7):23-26.
Authors:Tu YiQiang  Li XiaoCheng  Yang ZengQi  Xu Hui  Cheng Jie  Wu FaXin  Huang BaoXu
Institution:Tu YiQiang1,2),Li XiaoCheng1),Yang ZengQi2),Xu Hui2),Cheng Jie1),Wu FaXin1),Huang BaoXu1)
Abstract:
Keywords:Hog cholera virus(HCV)  E2gene  Sequence Analysis
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