| 龙眼GDSL酯酶/脂肪酶基因的全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 刘梦雨,蒋梦琦,陈燕,张舒婷,薛晓东,肖学宸,赖钟雄,林玉玲.龙眼GDSL酯酶/脂肪酶基因的全基因组鉴定及表达分析[J].园艺学报,2022(3):597-612. |
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| 作者姓名： | 刘梦雨 蒋梦琦 陈燕 张舒婷 薛晓东 肖学宸 赖钟雄 林玉玲 |
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| 作者单位： | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31672127)；;福建省自然科学基金项目(2020J01543)； |
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| 摘 要： | 基于第三代龙眼基因组数据库及其转录组数据库，通过生物信息学分析对龙眼GDSL酯酶/脂肪酶家族进行全基因组鉴定。结果显示龙眼GDSL(Dl GDSL)家族共有118个成员，分为15个亚家族，亚细胞定位显示主要分布于细胞外基质中。染色体位置及共线性基因分析表明，118个Dl GDSL基因中有111个定位在15条龙眼染色体上，包括13对共线性基因。基因结构和蛋白质保守基序分析表明该家族的外显子在2～12之间，且motif2和motif3是Dl GDSL家族中尤为重要的保守基序。启动子顺式作用元件分析表明，启动子序列中包含众多光响应、激素应答、无氧诱导、胁迫响应和昼夜节律等响应元件，且大部分成员都含有茉莉酸甲酯(Me JA)、脱落酸(ABA)、生长素(IAA)和赤霉素(GA)等激素应答作用元件。FPKM值分析发现从胚性愈伤组织到球形胚阶段有26个差异表达的基因，提示Dl GDSL家族部分成员可能在龙眼体胚形态建成中发挥重要作用。q RT-PCR分析表明，在外源ABA和Me JA处理下龙眼胚性愈伤组织中，Dl GDSL家族部分成员可能与ABA、Me JA等激素信号转导相关。
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| 关 键 词： | 龙眼 GDSL 全基因组 鉴定 表达分析 |
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