| 鲑降钙素对虹鳟鳞组织lncRNA表达的影响 |
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| 引用本文： | 王刘永,周启苓,马骞,毛非凡,杨二军,陈刚.鲑降钙素对虹鳟鳞组织lncRNA表达的影响[J].中国水产科学,2022,29(7):1091-1100. |
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| 作者姓名： | 王刘永 周启苓 马骞 毛非凡 杨二军 陈刚 |
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| 作者单位： | 广东海洋大学水产学院, 广东 湛江 524025;广东海洋大学水产学院, 广东 湛江 524025 ；南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江), 广东 湛江 524025 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31772828)； 广东海洋大学科研启动经费资助项目(R19022). |
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| 摘 要： | 为探明鲑降钙素(salmon calcitonin, sCT)对鱼类骨组织钙代谢过程的调节机制, 对虹鳟(Oncorhynchus mykiss) 幼鱼进行 sCT 腹腔注射, 并在注射后 24 h 采集鳞组织进行转录组测序, 分析其中长链非编码 RNA (long non-coding RNA, lncRNA)表达水平的变化。结果显示, 注射 sCT 后的虹鳟鳞组织中共鉴定出 847 个差异表达的 lncRNA, 其中 247 个表达上调, 600 个表达下调。GO 注释结果显示, 差异表达 lncRNA 靶基因主要被注释到转录调控、运输、信号转导、膜、细胞质、金属离子结合和核苷酸结合等功能中。KEGG 通路富集结果显示, 差异表达 lncRNA 靶基因在硫胺素代谢通路、炎症介质对 TRP 通道调节、血小板活化、谷氨酸能突触、神经营养因子通路、ARVC 通路和 NF-kappa B 信号通路等通路中显著富集。利用实时荧光定量 PCR (quantitative real-time PCR, qRT-PCR)对随机选取的 6 个差异表达 lncRNA 的表达量进行验证, 结果显示, qRT-PCR 与 RNA-Seq 结果一致。基于上述结果, 本研究筛选到 MSTRG.68909.2、MSTRG.39805.1、MSTRG.121429.1、MSTRG.9137.1 和 MSTRG.43721.1 共 5 个可能参与虹鳟钙代谢的关键 lncRNA, 这些关键基因的筛选鉴别可为探明硬骨鱼类骨代谢的调控机理提供新的切入点, 为虹鳟养殖生产实践提供参考。
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| 关 键 词： | 虹鳟 钙代谢 长链非编码 RNA 转录组 鳞 |
Effects of salmon calcitonin on the expression of lncRNA in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) scales |
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| WANG Liuyong,ZHOU Qiling,MA Qian,MAO Feifan,YANG Erjun,CHEN Gang.Effects of salmon calcitonin on the expression of lncRNA in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) scales[J].Journal of Fishery Sciences of China,2022,29(7):1091-1100. |
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| Authors: | WANG Liuyong ZHOU Qiling MA Qian MAO Feifan YANG Erjun CHEN Gang |
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