| 鹿科与牛科动物IGF-1基因序列比较及分子进化分析 |
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| 引用本文： | 宋兴超,徐超,王雷,巴恒星,王桂武,杨福合.鹿科与牛科动物IGF-1基因序列比较及分子进化分析[J].家畜生态学报,2014,35(3):14-18. |
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| 作者姓名： | 宋兴超 徐超 王雷 巴恒星 王桂武 杨福合 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院特产研究所 吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(2012CB722907);国家科技支撑计划项目(2011BAI03B02) |
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| 摘 要： | 以GenBank中已登录的梅花鹿(Cervus nippon)、马鹿(Cervus elaphus)、普通牛(Bos taurus)、水牛(Bubalus bubalis)、山羊(Capra hircus)和绵羊(Ovis aries)胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因mRNA序列为研究材料,通过DNAStar 7.0等生物信息学软件对6个物种的IGF-1基因进行序列比较及分子进化分析。结果表明:鹿科与牛科动物IGF-1基因编码区均为465bp,并且碱基组成表现为GCAT,且G+C含量高于A+T;6个物种IGF-1基因密码子第1位富含A,密码子第2位4种碱基的分布相对均匀,密码子的第3位碱基C含量较高;编码区碱基序列中共检测到20个变异位点,包括10个单一变异和10个简约变异,鹿科和牛科动物IGF-1基因核苷酸和氨基酸序列的相似性均较高;(4)NJ和UPGMA两种方法构建的分子进化树均把6个物种聚为2个大类:鹿科和牛科,其中牛科又分支出牛亚科和羊亚科两类。
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| 关 键 词： | 鹿科 牛科 胰岛素样生长因子-1基因 序列比较 密码子 |
Sequence Comparison and Molecular Evolution Analysis of IGF 1
Gene of Cervidae and Bovidae Species |
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| SONG Xing-chao;XU Chao;WANG Lei;Ba Heng-xing;WANG Gui-wu;YANG Fu-he.Sequence Comparison and Molecular Evolution Analysis of IGF 1
Gene of Cervidae and Bovidae Species[J].Acta Ecologae Animalis Domastici,2014,35(3):14-18. |
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| Authors: | SONG Xing-chao;XU Chao;WANG Lei;Ba Heng-xing;WANG Gui-wu;YANG Fu-he |
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| Institution: | SONG Xing-chao;XU Chao;WANG Lei;Ba Heng-xing;WANG Gui-wu;YANG Fu-he;State Key Laboratory of Special Economic Animal Molecular Biology,Institute of Special Animal and Plant Science of CAAS; |
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