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黄颡鱼生长抑素基因的克隆及表达谱分析
引用本文:梁宏伟,曹 磊,李 忠,等.黄颡鱼生长抑素基因的克隆及表达谱分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2015,43(3):43-50.
作者姓名:梁宏伟  曹 磊  李 忠  
作者单位:中国水产科学研究院 长江水产研究所;淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心,中国水产科学研究院 长江水产研究所;华中农业大学 水产学院,中国水产科学研究院 长江水产研究所;华中农业大学 水产学院
基金项目:国家“863”计划项目(2011AA100401);国家水产种质资源平台项目
摘    要:【目的】克隆黄颡鱼生长抑素(Somatostatin,SS)基因cDNA全长序列,分析其在黄颡鱼胚胎发育、胚后发育阶段及成鱼各个组织中的表达规律。【方法】以黄颡鱼脑组织为材料,根据瓦氏黄颡鱼和斑点叉尾鮰SS基因保守区设计1对引物用于扩增SS基因中间保守区序列,再根据中间保守区序列设计2对引物,分别用于扩增5′端和3′端序列,将扩增得到的中间保守区序列、5′端和3′端序列拼接后得到黄颡鱼SS基因的cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析。用NCBI的Protein Blast对黄颡鱼与其他物种SS基因编码的氨基酸序列同源性进行比较,并构建系统发育树。用实时荧光定量RT-PCR检测SS基因在胚胎发育时期和胚后发育阶段(1~20 d)的表达特征。采用半定量RT-PCR检测SS基因在黄颡鱼脑、心脏、肌肉、胃、肝脏、肾脏、鳃、脾脏、性腺等组织中的表达特征。【结果】黄颡鱼SS基因cDNA全长694 bp,其中5′端非翻译区139 bp,3′端非翻译区211 bp,开放阅读框为345 bp,编码114个氨基酸。黄颡鱼与瓦氏黄颡鱼SS基因编码氨基酸同源性最高,为98%。系统发育树结果显示,黄颡鱼与同属于鲇形目的瓦氏黄颡鱼和斑点叉尾鮰聚为一支。SS基因在黄颡鱼受精卵时期就有表达,并持续至胚胎孵化出膜,且在心跳期和出膜期的表达量显著高于受精卵时期(P<0.05);在出膜后的1~20 d,SS基因在黄颡鱼中稳定表达;在成鱼的各个组织中,SS基因只在脑组织中特异性表达。【结论】初步探明了SS基因在黄颡鱼胚胎发育、胚后发育阶段及成鱼各组织中的表达规律,推测其可能在黄颡鱼胚胎发育中发挥着重要的生理功能。

关 键 词:黄颡鱼  生长抑素  基因克隆  表达特征
收稿时间:2013/11/1 0:00:00

Cloning and expression analysis of somatostatin gene in Pelteobagrus fulvidraco
Abstract:
Keywords:Pelteobagrus fulvidraco  somatostatin  gene clone  expression characterization
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