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‘岩溪晚芦’椪柑果皮与果肉差减cDNA文库的构建及初步分析
引用本文:叶庆亮,江东,彭爱红.‘岩溪晚芦’椪柑果皮与果肉差减cDNA文库的构建及初步分析[J].园艺学报,2009,36(7):967-974.
作者姓名:叶庆亮  江东  彭爱红
作者单位:(中国农业科学院柑橘研究所,重庆 400712)
基金项目:国家科技支撑计划,国家重点基础研究发展规划(973计划),重从市自然科学基金 
摘    要: 以‘岩溪晚芦’(Citrus reticulata Blanco)成熟果皮和果肉为材料,采用抑制性差减杂交技术,成功构建了果皮(tester)与果肉(driver)的差减cDNA文库。结果显示:cDNA克隆外源插入片段大小介于100~500 bp之间。成功对411个克隆进行了测序,测序结果经与NCBI基因库中序列进行比较,377个EST 找到了同源序列,它们分属于126个基因,涉及到与色素合成、能量代谢、初级代谢、次生代谢、抗逆防御、蛋白代谢、信号转导、香味形成、果皮软化(衰老)、精油合成、抗氧化代谢等代谢途径和生理生化过程。还有一些基因涉及到三价铁螯合物、反转录转座子gag蛋白、查尔酮合成、硼离子转运、儿茶酚氧位甲基转移酶等功能。功能已知且没有重复的EST共有63个,占总数的49.2%。有5个基因共62个克隆虽在Blast搜索时找到了较高的同源性序列,但功能目前尚未明确,有待进一步深入分析。另有34个基因未搜索到同源序列,可能为新发现的基因。

关 键 词:柑橘  抑制性差减杂交(SSH)  cDNA文库  表达序列标签  克隆  差异表达基因
收稿时间:2009-01-19

Construction of a Subtractive cDNA Library Between Fruit Epicarp and Pulp of Ponkan Mandarin and Primary Analyses of the Sequences
YE Qing-liang,JIANG Dong,PENG Ai-hong.Construction of a Subtractive cDNA Library Between Fruit Epicarp and Pulp of Ponkan Mandarin and Primary Analyses of the Sequences[J].Acta Horticulturae Sinica,2009,36(7):967-974.
Authors:YE Qing-liang  JIANG Dong  PENG Ai-hong
Institution:(Citrus Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Chongqing 400712,China)
Abstract:
Keywords:citrus  suppression subtractive hybridization(SSH  cDNA library  expressed sequence tag  clone  differentially expressed genes
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