| 基于中麻黄萌发种子转录组的黄酮类化合物合成途径基因的挖掘 |
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| 引用本文： | 邓楠,史胜青,常二梅,刘建锋,兰倩,江泽平.基于中麻黄萌发种子转录组的黄酮类化合物合成途径基因的挖掘[J].林业科学研究,2014,27(6):758-763. |
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| 作者姓名： | 邓楠 史胜青 常二梅 刘建锋 兰倩 江泽平 |
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| 作者单位： | 中国林业科学研究院林业研究所 北京 100091 |
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| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(RIF2010-10);林木遗传育种国家重点实验室专项课题(TGB2013012) |
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| 摘 要： | 应用新一代高通量测序技术(Illumina Solexa),对中麻黄(Ephedra intermedin)同萌期的种子进行转录组测序,数据重头(denovo)组装后,共获得52 007条Unigene序列,总长为25 043 596 bp。COG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了64 751个GO功能注释,17 701个COG功能注释以及16 942个KEGG注释,并从KEGG通路中找到参与黄酮类化合物合成途径的关键基因片段283个,其中包含了查尔酮合酶基因、细胞色素相关基因和花青素还原酶等基因。中麻黄转录组测序工作的完成,极大地扩充了麻黄的基因资源,为麻黄属植物分子系统进化分析、抗性和药用功能基因的发掘与利用、遗传改良等研究奠定基础。
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| 关 键 词： | 中麻黄 转录组 黄酮类化合物 高通量测序 |
| 收稿时间： | 2014/4/28 0:00:00 |
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