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核桃基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析
引用本文:周贝贝,文明,马庆国,裴东.核桃基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析[J].林业科学研究,2014,27(6):741-744.
作者姓名:周贝贝  文明  马庆国  裴东
作者单位:1. 中国林业科学研究院林业研究所,林木遗传育种国家重点实验室,北京100091
2. 凉山州林业局,四川凉山,615500
基金项目:国家自然科学基金项目(31171933)
摘    要:以‘中宁强’核桃品种成熟叶片为材料,采用优化的MSAP反应体系,在全基因组水平对核DNA进行甲基化修饰位点分析,结果表明:选用20对引物组合,共扩增出1 060条清晰、重复性好的谱带,平均每对引物扩增出53条谱带,其中,甲基化位点241个,甲基化修饰比例为22.73%。对部分核桃DNA甲基化修饰位点进行回收测序,得到10条存在DNA甲基化修饰的DNA序列,BLASTn分析表明,核桃基因组中多种类型的DNA序列存在甲基化修饰现象。

关 键 词:核桃  MSAP  DNA甲基化  表观遗传学
收稿时间:2013/12/22 0:00:00

Analysis of Genomic DNA Methylation Modification of Walnut by Methylation-sensitive Amplification Polymorphism
ZHOU Bei-bei,WEN Ming,MA Qing-guo and PEI Dong.Analysis of Genomic DNA Methylation Modification of Walnut by Methylation-sensitive Amplification Polymorphism[J].Forest Research,2014,27(6):741-744.
Authors:ZHOU Bei-bei  WEN Ming  MA Qing-guo and PEI Dong
Institution:Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Beijing 100091, China;Forestry Bureau of Liangshan Prefecture, Liangshan 615500, Sichuan, China;Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Beijing 100091, China;Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Beijing 100091, China
Abstract:
Keywords:Juglans regia  methylation-sensitive amplification polymorphism  DNA methylation  epigenetic
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