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沪油15中两个AP2/ERF-B1亚族转录因子的克隆与分析
引用本文:庄静,彭日荷,高峰,付晓燕,朱波,金晓芬,Jian Zhang,熊爱生,姚泉洪.沪油15中两个AP2/ERF-B1亚族转录因子的克隆与分析[J].核农学报,2009,23(3):435-441.
作者姓名:庄静  彭日荷  高峰  付晓燕  朱波  金晓芬  Jian Zhang  熊爱生  姚泉洪
作者单位:1. 上海市农业科学院,上海,201106;加拿大艾伯塔省研究院,埃德蒙顿,T9C,1T4
2. 上海市农业科学院,上海,201106
3. 加拿大艾伯塔省研究院,埃德蒙顿,T9C,1T4
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划),上海市青年科技启明星跟踪计划,上海市自然科学基金,上海市国际合作项目 
摘    要:利用油菜EST数据库,以拟南芥ERF-B1亚族转录因子序列为探针,电子克隆拼接得到2个cDNA序列(BnaERFB1-1和BnaERFB1-2),通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型油菜沪油15的DNA和cDNA中克隆了上述基因。克隆转录因子BnaERFB1-1-Hy15和BnaERFB1-2-Hy15与电子克隆的序列差异很小,分别只有2个和6个氨基酸位点不同,且都没有内含子。从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、进化树、序列比对、功能域、二级和三级结构等方面进行了分析,结果显示,BnaERFB1-1-Hy15和BnaERFB1-2-Hy15转录因子属于AP2/ERF家族中的ERF-B1亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与拟南芥atERF7相似。EST丰度分析显示,BnaERFB1-1的表达主要集中在种子中,而BnaERFB1-2的表达则主要集中在分生组织中。

关 键 词:AP2/ERF  B1亚族  转录因子  克隆  沪油15
收稿时间:2008-09-23

CLONING AND ANALYSIS OF AP2/ERF-B1 SUBFAMILY TRANSCRIPTION FACTORS FROM Brassica napus L. HUYOU 15
ZHUANG Jing,PENG Ri-he,GAO Feng,FU Xiao-yan,ZHU Bo,JIN Xiao-feng,Jian Zhang,XIANG Ai-sheng,YAO Hong-quan.CLONING AND ANALYSIS OF AP2/ERF-B1 SUBFAMILY TRANSCRIPTION FACTORS FROM Brassica napus L. HUYOU 15[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2009,23(3):435-441.
Authors:ZHUANG Jing  PENG Ri-he  GAO Feng  FU Xiao-yan  ZHU Bo  JIN Xiao-feng  Jian Zhang  XIANG Ai-sheng  YAO Hong-quan
Institution:1;2;1.Shanghai Academy of Agricultural Sciences;Shanghai 201106;2.Alberta Research Council of Canada;Edmonton;T9C1T4
Abstract:
Keywords:AP2/ERF
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