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猪繁殖与呼吸综合征病毒CH-1a株非结构基因的分子克隆及其基因特征的研究
引用本文:刘光清,薛强,仇华吉,蔡雪晖,童光志,郭宝清.猪繁殖与呼吸综合征病毒CH-1a株非结构基因的分子克隆及其基因特征的研究[J].中国预防兽医学报,2002(2).
作者姓名:刘光清  薛强  仇华吉  蔡雪晖  童光志  郭宝清
作者单位:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,中国农业科学院哈尔滨兽医研
基金项目:国家重点基础研究发展规划项目 (973,批准号 :19990 1190 2 ),国家自然科学基金 (批准号 :30 0 0 0 12 2 )资助
摘    要:对猪繁殖与呼吸综合征病毒的非结构基因 (ORF1)和非编码区分别进行了克隆和测序 ,并对其基因特征作了分析。结果表明 ,CH_1a株ORF1全长 11882nt,其中ORF1a长 75 12nt、ORF1b长 4374nt。它们与VR2 332株的核苷酸同源性分别为 89%、92 % ;与LV株的核苷酸同源性分别为 5 4%、6 3.3%。ORF1编码两个聚合蛋白 ,其中ORF1a编码的聚合蛋白经裂解后产生 6个成熟的非结构蛋白 (Nsp1α、Nsp1β、Nsp2_5 ) ,以Nsp2的变异性最为显著 ,它与LV株的氨基酸同源性为 41%。ORF1b编码的聚合蛋白经裂解后 ,产生 4个成熟的非结构蛋白 (RdRpCP2_4) ,其中RdRp为病毒的复制酶 ,CP4表现出较大的变异性 ,与LV株的氨基酸同源性为 48%。在ORF1a_ORF1b的衔接区有保守的庚核苷酸滑动序列和拟节结构 ,它们是核糖体移码翻译所必需的结构。在基因组末端存在非编码区 ,其中 5’NCR长 190nt,比LV株 5’NCR短 31nt,其核苷酸同源性为 6 1%。 3’NCR长 15 1nt,比LV株 3’NCR长 37nt,保守性稍高 ,其与VR2 332株和LV株的核苷酸同源性分别为 95 .4%和 78.2 %。在 3’NCR末端有一个poly(A)尾巴 ,长 2 0nt。在Poly(A)尾上游有保守的八核苷酸序列 ,是复制酶识别并结合的区域。本研究进一步证实CH_1a株在基因型上属于北美洲型

关 键 词:PRRSV  非结构基因  非结构蛋白编码区  序列分析

Molecular Cloning and Sequence Analysis of the NSP Coding Region of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus CH-1a Strain
LIU Guang-qing,XUE Qiang,QIU Hua-ji,CAI Xue-hui,TONG Guang-zhi,GUO Bao-qing.Molecular Cloning and Sequence Analysis of the NSP Coding Region of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus CH-1a Strain[J].Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine,2002(2).
Authors:LIU Guang-qing  XUE Qiang  QIU Hua-ji  CAI Xue-hui  TONG Guang-zhi  GUO Bao-qing
Abstract:
Keywords:PRRSV  Non-structural protein  Non-coding region  Sequence analysis
本文献已被 CNKI 等数据库收录!
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