| 干酪乳杆菌HDS-01甘露聚糖酶基因克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 宁莹莹,张鑫,赵丹.干酪乳杆菌HDS-01甘露聚糖酶基因克隆及生物信息学分析[J].中国农学通报,2023(26):33-40. |
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| 作者姓名： | 宁莹莹 张鑫 赵丹 |
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| 作者单位： | 1. 黑龙江大学生命科学学院/农业微生物技术教育部工程研究中心/黑龙江省寒区植物基因与生物发酵重点实验室/黑龙江省普通高校微生物重点实验室;2. 长春金赛药业有限责任公司 |
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| 摘 要： | 本研究旨在借助基因克隆和生物信息学方法挖掘甘露聚糖酶基因的结构和功能。通过本地BLAST比对，从干酪乳杆菌(Lactobacillus casei) HDS-01的基因组信息中获得甘露聚糖酶基因M1。采用qRT-PCR测定MRS培养基和KGM培养基中M1的差异表达情况，表明KGM培养基中的魔芋粉更好的诱导M1的表达。以L.casei HDS-01基因组DNA为模板克隆基因M1，并利用生物信息学方法对其序列进行预测和分析。该序列长2640 bp，可翻译成879个氨基酸，包括一个2640 bp的开放阅读框；M1蛋白分子量为98723.55 Da，等电点为5.58。这种稳定的M1蛋白的二级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规则卷曲组成。研究结果不仅为甘露聚糖酶分子改造提供理论依据，同时有助于了解乳酸菌中甘露聚糖的代谢路径。
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| 关 键 词： | 干酪乳杆菌 生物信息学 克隆 甘露聚糖酶 蛋白质二级结构 |
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