| 基于RNA-Seq技术分析不同产蛋量庄河大骨鸡垂体和下丘脑的可变剪接事件 |
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| 引用本文： | 马智勇,李美成,马巍,王春强.基于RNA-Seq技术分析不同产蛋量庄河大骨鸡垂体和下丘脑的可变剪接事件[J].中国农学通报,2023(32):150-157. |
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| 作者姓名： | 马智勇 李美成 马巍 王春强 |
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| 作者单位： | 锦州医科大学畜牧兽医学院 |
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| 基金项目： | 国家级大学生创新训练项目“NGF-FSH协同调节ABP表达对睾丸支持细胞的作用的初步研究”(201910160012)； |
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| 摘 要： | 近年来，庄河大骨鸡个体产蛋数量出现较大差异。可变剪接(Alternative splicing,AS)是真核基因转录后调控的重要机制，但目前尚无关于AS与禽垂体和下丘脑产蛋量相关性的研究。本试验基于RNA-Seq技术对大骨鸡AS事件进行分析。结果表明：在垂体和下丘脑文库中分别检测到769和813个差异AS事件。2种文库（垂体、下丘脑）中均鉴定出5种类型的AS事件，其中外显子跳跃(SE)的比例最高，而替代5’剪接位点(A5SS)的比例最低；NRCAM,SLMAP和CIB1基因的AS发生频率较高；2种组织文库中分别筛选出644和680个差异剪接基因(DSGs)，其中SE的比例最高，A5SS的比例最低。GO和KEGG富集分析分别对329个和337个DSG进行功能注释；RT-PCR检测发现，ESR1存在于不同的AS事件中；12个文库中共获得6758个新的转录本，优化了12486个基因。研究结果不仅扩展了对家禽垂体和下丘脑组织中AS事件的认识，且为研究生产中提高鸡的产蛋量提供新的思路。
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| 关 键 词： | 鸡 可变剪接 RNA-Seq 差异剪接基因 产蛋量 |
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