| 镉胁迫下桑树幼苗的转录组分析 |
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| 引用本文： | 王晓红,韩世玉,孙运朋,张芳,罗泽虎,陈彪.镉胁迫下桑树幼苗的转录组分析[J].中国农学通报,2023(13):25-34. |
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| 作者姓名： | 王晓红 韩世玉 孙运朋 张芳 罗泽虎 陈彪 |
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| 作者单位： | 贵州省农业科学院蚕业研究所 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-18-SYZ21)； |
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| 摘 要： | 为研究桑树幼苗对重金属镉胁迫应答的分子机制，挖掘与镉胁迫相关的功能基因，利用Illumina HiSeq测序方法对正常和CdCl2胁迫条件下的桑树幼苗进行转录组学研究。基于从头转录组组装，从镉胁迫下的桑树幼苗中分离到39758个非冗余转录本。这些转录本的平均长度和N50分别为1135、1968 bp，平均GC含量为41.72%。从不同的镉胁迫时期鉴定得到15882个差异表达基因。KEGG途径富集分析表明，这些差异表达基因分别主要参与光合作用、次生代谢和能量代谢相关途径。此外，36个转录因子家族的148个转录因子在不同镉胁迫时期存在差异表达，包括bHLH、MYB、B3、NAC、MYB-related等。qRT-PCR显示差异表达基因的表达谱与RNA-Seq分析结果一致。研究结果可为了解桑树对镉的耐受机制提供依据。
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| 关 键 词： | 桑树 镉胁迫 转录组 生物信息 基因表达 |
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