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基于线粒体COI序列的江淮下游湖泊鲢群体遗传多样性和遗传结构分析
引用本文:李大命,杨子萍,刘燕山,谷先坤,殷稼雯,蔡永久,唐晟凯,张彤晴.基于线粒体COI序列的江淮下游湖泊鲢群体遗传多样性和遗传结构分析[J].淡水渔业,2023(4):3-11.
作者姓名:李大命  杨子萍  刘燕山  谷先坤  殷稼雯  蔡永久  唐晟凯  张彤晴
作者单位:1. 江苏省淡水水产研究所江苏省内陆水域渔业资源重点实验室;2. 南京师范大学海洋科学与工程学院;3. 中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室
摘    要:本研究采用线粒体COI序列为分子标记,探究了长江、淮河下游8个湖泊鲢(Hypophthalmichthys molitrix)群体的遗传多样性和遗传结构。通过PCR和测序技术,获得鲢COI基因序列片段。分析结果显示:COI序列片段长度为630 bp, 243条COI序列共检出23个变异位点,定义14种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.692和0.005 12。8个群体的单倍型多样性为0.508~0.803,核苷酸多样性为0.002 41~0.006 94,表明鲢群体的遗传多样性有较大差异。分子方差分析结果显示,遗传变异主要来自于群体内,遗传分化指数(FST)为0.008 3,表明群体间没有显著遗传分化。系统发育树和网络结构图显示,单倍型分化为2个分支,但群体没有形成特定的地理遗传结构。中性检验结果和歧点分布曲线表明,鲢群体没有显著偏离中性选择,群体大小保持相对稳定。

关 键 词:鲢(Hypophthalmichthys  molitrix)  COI基因  遗传多样性  遗传结构
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