闽楠bZIP基因家族的鉴定与表达分析 |
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引用本文: | 万露露,王中煊,沈军,曹泽宇,陈世品,苏小青.闽楠bZIP基因家族的鉴定与表达分析[J].福建农林大学学报(自然科学版),2024(2):221-228. |
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作者姓名: | 万露露 王中煊 沈军 曹泽宇 陈世品 苏小青 |
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作者单位: | 1. 福建农林大学林学院;2. 福建农林大学兰科植物保护与利用国家林业和草原局重点实验室;3. 福建农林大学园艺学院 |
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摘 要: | 【目的】基于闽楠全基因组数据对bZIP(碱性亮氨酸拉链)基因家族进行鉴定,并研究其在闽楠根系水分胁迫下的作用,确定关键调控基因。为进一步探究闽楠根系抵御逆境胁迫的分子机制提供了参考。【方法】利用生物信息学方法进行系统进化、保守基序、基因结构、启动子顺式势作用元件以及蛋白互作分析,并通过qRT-PCR验证基因在水分胁迫下的表达模式。【结果】在闽楠基因组中共鉴定出52个bZIP转录因子,划分为10个亚家族;顺式作用元件分析表明,PbbZIP可能响应光照、生物与非生物胁迫以及生长发育等生物学过程;转录组数据分析显示,PbbZIP15在干旱/水涝胁迫下的表达量较高,PbbZIP40在干旱胁迫下的表达量较高;qRT-PCR验证结果与转录组数据基本一致。【结论】PbbZIP15和PbbZIP40是调控闽楠根系水分胁迫的2个关键基因。
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关 键 词: | 闽楠 bZIP基因家族 全基因组鉴定 水分胁迫 表达分析 |
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