水稻MYB-MYC基因家族的全基因组鉴定、系统进化和表达模式分析 |
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引用本文: | 刘 玥,陈守坤,王成微,李家伟,李海峰.水稻MYB-MYC基因家族的全基因组鉴定、系统进化和表达模式分析[J].西北农业学报,2019,28(11):1790-1800. |
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作者姓名: | 刘 玥 陈守坤 王成微 李家伟 李海峰 |
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作者单位: | (旱区作物逆境生物学国家重点实验室,西北农林科技大学 农学院,陕西杨凌 712100) |
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基金项目: | 陕西省自然科学基金(2014JM3065)。 |
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摘 要: | 为了挖掘水稻MYB-MYC基因的功能,通过生物信息学手段对水稻MYB-MYC基因家族进行基因组水平的鉴定,并对其系统进化及表达模式进行分析。本研究在水稻中鉴定到17个MYB-MYC基因,根据系统进化树将它们划分为2个亚家族,不同亚组具有特异的保守基序和基因结构。通过对水稻MYB-MYC基因复制事件的分析发现水稻MYB-MYC基因共产生6个基因复制。此外,转录组数据分析发现水稻MYB-MYC基因在不同组织都存在表达且响应不同非生物胁迫。本试验为水稻MYB-MYC基因功能的研究提供了初步的理论基础。
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关 键 词: | 水稻 MYB-MYC 系统进化 表达模式 |
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