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| 全基因组关联分析阈值的快速算法 | |
| 引用本文： | 野金花,方铭,徐艳,高德宝,周晓晶,张巧生,张莹.全基因组关联分析阈值的快速算法[J].黑龙江八一农垦大学学报,2019,31(3). |
| 作者姓名： | 野金花 方铭 徐艳 高德宝 周晓晶 张巧生 张莹 |
| 作者单位： | 黑龙江八一农垦大学理学院,大庆,163319;集美大学水产学院;黑龙江八一农垦大学动物科学技术学院 |
| 基金项目： | 大庆市指导项目;校内培育课题 |
| 摘 要： | 逐个SNP的全基因组关联分析中的统计量不仅依赖于遗传效应,而且依赖于SNP,因此统计量不能直接应用于推断无遗传效应的零假设中。检测不同样本的QTN,常用的统计量除了卡方统计量,还有t统计量、F统计量和标准正态统计量。首先给出了各个统计量之间的关系,接下来针对冗余参数背景下的全基因组关联分析,提出了检验统计量阈值的快速计算方法。再次利用获得的高通量SNP的统计概率构建卡方统计量,进而估计临界值。最后模拟不同样本的阈值并与文献上提出的阈值算法比较。大量模拟实验证明,提出的方法快速而且有效。 |
| 关 键 词： | 统计量 阈值 全基因组关联分析 模拟 |
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