欧亚葡萄“魏可”不同着色期果皮转录组差异分析 |
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引用本文: | 魏世平,李静,解振强.欧亚葡萄“魏可”不同着色期果皮转录组差异分析[J].中国果业信息,2023,52(5). |
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作者姓名: | 魏世平 李静 解振强 |
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作者单位: | 江苏农林职业技术学院,江苏农林职业技术学院,江苏农林职业技术学院 |
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基金项目: | 江苏农林职业技术学院科技项目(2020kj040),江苏省科技支撑计划(乡村产业振兴)富民强村科技帮促(SK-SH2022002),江苏省第六期“333高层次人才培养工程”第三层次培养对象资助项目,江苏农林职业技术学院科技项目(2021kj17,2021kj40),国家自然科学基金青年项目(42207371)资助 |
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摘 要: | 为探明欧亚葡萄“魏可”在果皮转色过程中转录组水平的变化,于果皮转色期、转色后15天以及完熟期采集果实样品,利用RNA-Seq测序技术,对转色过程中相关基因表达量的变化规律进行探讨。结果得到葡萄转色不同阶段在转录组水平上存在显著差异表达基因。转色后15天vs转色期、完熟期vs转色期以及完熟期vs转色后15天之间的显著差异基因数分别为3096个、4444个和 1156个,且均含有显著上调和显著下调基因。 GO富集分析表明,转色后15天vs转色期在整体上以及下调差异表达基因间、完熟期vs转色期在整体上以及上下调差异表达基因间、完熟期vs转色后15天在上调差异表达基因间存在显著富集过程。鉴定出KEGG富集的代谢通路有10条,分别在转色后15天vs转色期下调差异表达基因、完熟期vs转色期上下调差异表达基因、完熟期vs转色后15天下调差异表达基因之间,主要涉及光合作用和半乳糖代谢途径。转录因子分析共鉴定出62个转录因子基因家族的446个转录因子。欧亚葡萄“魏可”果皮转色过程中转录组水平上相关基因表达量存在显著差异,且GO和KEGG注释分析均鉴定出显著富集的过程及代谢途径。为进一步大量挖掘与“魏可”葡萄果皮转色相关重要表达基因奠定一定的数据基础和科学参考。
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关 键 词: | “魏可”葡萄,转色期,转录组水平,差异表达基因 |
收稿时间: | 2022/12/31 0:00:00 |
修稿时间: | 2023/3/10 0:00:00 |
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