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陆地棉微管结合蛋白CLASP家族基因的鉴定及表达分析
引用本文:朱守鸿,赵兰杰,刘永昌,李艳军,张新宇,孙杰.陆地棉微管结合蛋白CLASP家族基因的鉴定及表达分析[J].作物学报,2017,43(3):389-398.
作者姓名:朱守鸿  赵兰杰  刘永昌  李艳军  张新宇  孙杰
基金项目:This study was support by the National Natural Science Foundation (U1128301), the Doctor Funds of Xinjiang Crops (2013BB003), and the Startup Project of Advanced Talents of Shihezi University (RCZX201218).
摘    要:CLASP蛋白(CLIP-associated protein,CLASP)是一种调节微管结构与功能的微管结合蛋白,在植物生长发育及形态建成过程中起着至关重要的作用。本研究利用生物信息学的方法,在陆地棉基因组数据库中鉴定出6个编码CLASP蛋白的基因。多重序列比对及系统进化树分析表明,陆地棉CLASPs可分为2个亚家族(I和II),亚家族I含有HEAT重复结构域和典型的CLASP-N端结构域,亚家族II只含有CLASP-N端结构域。实时荧光定量PCR结果表明,6个CLASPs基因在棉花各组织中均有表达,但表达模式各不相同,其中CotAD_63740(Gen Bank登录号为KX881965)和CotAD_04861(Gen Bank登录号为KX881961)在纤维中优势表达,CotAD_48232(Gen Bank登录号为KX881962)、CotAD_48665(Gen Bank登录号为KX881963)、CotAD_55570(Gen Bank登录号为KX881964)和CotAD_68468(Gen Bank登录号为KX881966)在茎中优势表达,表达模式的不同表明CLASPs在棉花不同组织中功能不同。本研究为深入研究棉花CLASPs的功能奠定了基础。

关 键 词:陆地棉  微管结合蛋白  微管  表达分析
收稿时间:2016-04-04

Identification and Expression Analysis of Microtubule Binding Protein CLASP Family Genes in Gossypium hirsutum L.
ZHU Shou-Hong,ZHAO Lan-Jie,LIU Yong-Chang,LI Yan-Jun,ZHANG Xin-Yu,SUN Jie.Identification and Expression Analysis of Microtubule Binding Protein CLASP Family Genes in Gossypium hirsutum L.[J].Acta Agronomica Sinica,2017,43(3):389-398.
Authors:ZHU Shou-Hong  ZHAO Lan-Jie  LIU Yong-Chang  LI Yan-Jun  ZHANG Xin-Yu  SUN Jie
Institution:College of Agronomy, Shihezi University / Key Oasis Eco-agriculture Laboratory of Production and Construction Group, Shihezi 832003, China
Abstract:
Keywords:Gossypium hirsutum L  Microtubule binding protein  Microtubule  Expression analysis
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