| 甘蔗独脚金内酯生物合成关键基因ScD27的克隆与表达分析 |
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| 引用本文： | 吴转娣,刘新龙,刘家勇,昝逢刚,李旭娟,刘洪博,林秀琴,陈学宽,苏火生,赵培方,吴才文.甘蔗独脚金内酯生物合成关键基因ScD27的克隆与表达分析[J].作物学报,2017,43(1):31-41. |
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| 作者姓名： | 吴转娣 刘新龙 刘家勇 昝逢刚 李旭娟 刘洪博 林秀琴 陈学宽 苏火生 赵培方 吴才文 |
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| 摘 要： | 独脚金内酯(strigolactones,SLs)是一类新型植物激素,D27基因是独脚金内酯生物合成途径中最上游的调控基因,且该基因调控SLs的合成是一个可逆的过程。本研究根据水稻、玉米、高粱、二穗短柄草4种禾本科作物的D27基因核苷酸序列保守区域设计引物,以甘蔗品种ROC22的c DNA为模板,利用RT-PCR和RACE技术,从甘蔗中克隆出D27基因的c DNA全长序列,命名为Sc D27,Gen Bank登录号为KP987221.1。该基因序列全长1379 bp,包含一个867 bp的完整开放阅读框(ORF),编码288个氨基酸残基。Sc D27编码的蛋白质分子量为71.58 k D,理论等电点为5.04,是一种非分泌性蛋白,主要分布于叶绿体上,该蛋白的保守区可能具有2个锌指蛋白结构域(Zn F_TAZ和Zn F_A20),且不存在信号肽;该基因编码的氨基酸序列具有较高的保守性,与高粱、谷子、大麦、短穗二柄草等禾本科植物的D27氨基酸序列相似性在70%以上;Sc D27基因在甘蔗各组织部位均有表达,其中茎尖和腋芽中表达量较高,叶、茎和根中的表达较低。此外,Sc D27基因在甘蔗茎尖中的表达受PEG、盐胁迫、磷缺乏和营养缺乏的诱导,推测Sc D27基因是甘蔗独脚金内酯生物合成途径中响应非生物胁迫的关键基因。
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| 关 键 词： | 甘蔗 ScD27 同源克隆 生物信息学 q-PCR |
| 收稿时间： | 2016-01-11 |
Cloning and Expression Analysis of Key Gene ScD27 in Strigolactones Biosynthesis Pathway |
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| WU Zhuan-Di,LIU Xin-Long,LIU Jia-Yong,ZAN Feng-Gang,LI Xu-Juan,LIU Hong-Bo,LIN Xiu-Qin,CHEN Xue-Kuan,SU Huo-Sheng,ZHAO Pei-fang,WU Cai-Wen.Cloning and Expression Analysis of Key Gene ScD27 in Strigolactones Biosynthesis Pathway[J].Acta Agronomica Sinica,2017,43(1):31-41. |
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| Authors: | WU Zhuan-Di LIU Xin-Long LIU Jia-Yong ZAN Feng-Gang LI Xu-Juan LIU Hong-Bo LIN Xiu-Qin CHEN Xue-Kuan SU Huo-Sheng ZHAO Pei-fang WU Cai-Wen |
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| Institution: | Sugarcane Research Institute, Yunnan Academy of Agricultural Sciences / Yunnan Key Laboratory of Sugarcane Genetic Improvement, Kaiyuan 661699, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sugarcane ScD27 Homology cloning Bioinformatics q-PCR |
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