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不同引种黑莓品种的遗传多样性分析
引用本文:张春红,王小敏,闾连飞,李维林,吴文龙.不同引种黑莓品种的遗传多样性分析[J].经济林研究,2020,38(1):52-58.
作者姓名:张春红  王小敏  闾连飞  李维林  吴文龙
作者单位:江苏省中国科学院植物研究所,江苏南京 210014;南京林业大学林学院,江苏南京 210037
基金项目:江苏省农业科技自主创新项目
摘    要:【目的】开发适于黑莓Rubus spp.的EST-SSR引物,用于品种和种质的遗传多样性评价分析。【方法】基于前期获得的黑莓转录组数据,分析得到黑莓EST-SSR分子标记,筛查符合要求的SSR序列,设计合成127对较理想的EST-SSR引物进行扩增和多态性引物筛选,利用多态性好的引物用于18个引种黑莓栽培品种的遗传多样性分析。【结果】在127对引物中有125对可扩增出条带,有特异条带且大小符合预期的引物共有50对,50对引物中有45对具多态性的引物,占引物总数的36%,多数引物扩增的位点数为2~5。使用45对引物检测18个黑莓供试品种基因组DNA的多态性,共检测到191个等位基因变异,平均每个位点有4.24个等位基因,位点多态性信息含量为0.427~0.893,平均值为0.692。多态性最好的引物为Rh121,检测到8个等位基因,其次是Rh114和Rh118,均检测到7个等位基因。18份材料的遗传相似系数为0.49~0.88,表明品种间具有较丰富的遗传差异。利用UPGMA聚类,将18份种质分为3个类群,其中四倍体和多倍体黑莓品种明显归为不同类型,四倍体黑莓分为2类,相似育种产地的品种多聚在一起,推测与其品种遗传种质成分具一定相似性有关。【结论】EST-SSR标记可应用于黑莓品种种质遗传多样性分析,目前引种黑莓种质的遗传基础相对较窄。

关 键 词:黑莓  EST-SSR标记  引进品种  遗传多样性

Analysis on genetic diversity in different introduced Rubus spp.cultivars
ZHANG Chunhong,WANG Xiaomin,LüLianfei,LI Weilin,WU Wenlong.Analysis on genetic diversity in different introduced Rubus spp.cultivars[J].Economic Forest Researches,2020,38(1):52-58.
Authors:ZHANG Chunhong  WANG Xiaomin  LüLianfei  LI Weilin  WU Wenlong
Institution:(Institute of Botany,Jiangsu Province and Chinese Academy of Sciences,Nanjing 210014,Jiangsu,China;Institute of Forestry,Nanjing Forestry University,Nanjing 210037,Jiangsu,China)
Abstract:
Keywords:Rubus spp    EST-SSR marker  introduced cultivars  genetic diversity
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