| 杧果C2C2型锌指蛋白MiLSDs的生物信息及胁迫响应分析 |
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| 引用本文： | 刘志鑫,孙 宇,叶 子,罗睿雄,李 忠,蒲金基,张 贺,龚德勇.杧果C2C2型锌指蛋白MiLSDs的生物信息及胁迫响应分析[J].西北农业学报,2021(8):1175-1184. |
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| 作者姓名： | 刘志鑫 孙 宇 叶 子 罗睿雄 李 忠 蒲金基 张 贺 龚德勇 |
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| 作者单位： | (1.贵州大学 农学院,贵阳 550025；2.中国热带农业科学院 环境与植物保护研究所/农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室，海口 571101； 3.中国热带农业科学院 热带作物品种资源研究所，海口 571101； 4.贵州省亚热带作物研究所，贵州兴义 562400） |
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| 基金项目： | 国家重点研发专项（2019YFD1000504）；中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金（1630042017019，1630042021022）；农业农村部项目（黔科合支撑［2018］2284）。 |
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| 摘 要： | LSD（lesion simulating disease，LSD）基因编码一类特殊的C2C2型锌指蛋白，在细胞程序性死亡（Programmed cell death，PCD）和其他生物过程中发挥重要作用。通过鉴定杧果LSD基因家族成员并对其进行生物信息学分析，为探究杧果LSD转录因子在植物进化与发育中的生物功能奠定基础。根据杧果全基因组数据，对杧果LSD基因家族进行鉴定，包括理化性质、保守结构域、二级结构、三级结构、系统进化树分析等；采用实时荧光定量PCR方法，探究MiLSD基因在生物胁迫和激素处理下的表达模式。结果表明，杧果中共有3个LSD转录因子，其分子质量为10.36~17.58 ku，理论等电点（pI）为6.68~8.93；保守结构域、二级结构及三级结构分析发现MiLSDs成员具有较高保守性；系统发育树分析显示， MiLSD1、 MiLSD2、 MiLSD3分别分布在2个亚家族（ClassⅥ和ClassⅨ）。实时荧光定量PCR对胶孢炭疽菌（Colletotrichum gloeosporioides，Cg）、细菌性黑斑病菌（Xanthomonas citri pv. Mangiferaeindicae，Xcm）、水杨酸（Salicylic acid，SA）、茉莉酸甲酯（Methyl Jasmonate，MeJA）侵染下杧果叶片基因表达量的分析显示， MiLSD1在Cg侵染下表达量明显升高，说明 MiLSD1可能对胶孢炭疽菌侵染起正调控作用； MiLSD2在Xcm、SA处理下表达量也显著上调，说明 MiLSD2可能通过诱导SA来增加杧果对细菌性黑斑病的抗性； MiLSD3除在MeJA处理下表达量较高外其余3个处理均少量表达，说明 MiLSD3可能参与杧果对MeJA胁迫的响应而对于真菌和细菌侵染以及水杨酸胁迫并不表达；此外，在MeJA处理下 MiLSD1、 MiLSD2的表达量也显著上调，表明茉莉酸甲酯可能受MiLSDs的调控。
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| 关 键 词： | 锌指蛋白 LSD1基因 杧果 转录因子 |
Bioinformatics and Stress Response Analysis of C2C2 Zinc Finger Protein Gene MiLSD in Mango |
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| LIU Zhixin,SUN Yu,YE Zi,LUO Ruixiong,LI Zhong,PU Jinji,ZHANG He and GONG Deyong.Bioinformatics and Stress Response Analysis of C2C2 Zinc Finger Protein Gene MiLSD in Mango[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2021(8):1175-1184. |
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| Authors: | LIU Zhixin SUN Yu YE Zi LUO Ruixiong LI Zhong PU Jinji ZHANG He and GONG Deyong |
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