| β-内酰胺类抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响 |
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| 引用本文： | 张帅,曲永利,李伟,辛小月,王璐,殷术鑫.β-内酰胺类抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响[J].中国草食动物科学,2019(1):39-46. |
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| 作者姓名： | 张帅 曲永利 李伟 辛小月 王璐 殷术鑫 |
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| 作者单位： | 黑龙江八一农垦大学动物科技学院 |
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| 基金项目： | 黑龙江省基金项目(C2017044) |
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| 摘 要： | 为探究抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响,选取45头3日龄左右、体重40 kg±5 kg的健康荷斯坦犊牛,随机分为3组,分别饲喂巴氏消毒抗奶(B1)、抗奶(B2)和无抗鲜奶(B3),于60(T1)、90(T2)和180(T3)日龄,每组选取6头采集瘤胃液,构建犊牛瘤胃细菌宏基因组文库,并使用illumina MiSeq测序后通过NOG、KEGG和CAZy数据库进行生物信息学分析和功能注释。结果显示:(1)9个样品在eggNOG数据库中比对共有86 145条基因得到了相应的功能注释;CAZy数据库在9个功能类共获得33 980条注释;在KEGG通路注释得到1 905条。(2)T1-T2、T1-T3、B1-B2和B1-B3四组分别含有318、1 398、30和24个差异表达基因(DEGs)。T1-T2组和T1-T3组DEGs在细胞周期及氨基酸生物合成代谢途径中明显富集,其中细胞周期代谢主要的DEGs为糖原合酶激酶-3β基因(Glycogen synthase kinase-3β,GSK-3β);周期蛋白依赖性激酶2基因(Cyclindependent kinase 2,CDK2)和周期蛋白依赖性激酶7基因(Cyclin-dependent kinase 7,CDK7)。(3)试验共检测到6类抗生素抗性基因,共19种基因型。进一步分析抗生素耐药性产生机制,其中由外排泵(Efflux pump)引起的所占比例最大。说明牦牛随日龄的增加瘤胃菌群丰度提高,瘤胃菌群中的差异表达基因GSK-3β、CDK2和CDK7可能影响犊牛早期生长的乳脂代谢。
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| 关 键 词： | 犊牛 抗奶 瘤胃菌群 差异表达基因 抗性基因 |
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