| 野生和室内饲养高原鼠兔肠道菌群多样性的比较 |
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| 引用本文： | 谭春桃,李欢,曲家鹏.野生和室内饲养高原鼠兔肠道菌群多样性的比较[J].草业科学,2019,36(2). |
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| 作者姓名： | 谭春桃 李欢 曲家鹏 |
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| 作者单位： | 中国科学院西北高原生物研究所,青海 西宁 810008;中国科学院大学,北京 100049;兰州大学公共卫生学院,甘肃 兰州,730000;中国科学院西北高原生物研究所,青海 西宁 810008;青海省动物生态基因组学重点实验室,青海 西宁 810008 |
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| 基金项目： | 中国科学院战略性先导科技专项;国家自然科学基金;中国科学院青年创新促进会项目;青海省自然科学基金;青海省重点研发与转化计划项目;青海省重点实验室建设专项 |
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| 摘 要： | 肠道微生物在宿主的生理活动、免疫调节以及健康方面均有重要的作用。尽管已有报道表明高原鼠兔肠道菌群和食物、环境有关,但对于野生和室内饲养条件下,取食不同食物的高原鼠兔肠道菌群是否存在差异尚不清楚。本研究利用16S rRNA基因高通量测序技术比较夏季野生和室内饲养高原鼠兔的肠道菌群发现,与野生鼠兔相比,室内鼠兔有更高丰度的拟杆菌门(Bacteroidetes)和螺旋体门(Spirochetes),更低丰度的变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)。野生和室内饲养的鼠兔肠道共有的操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)有50.1%是重叠的,而49.9%的OTUs是各自特有的。野生和室内饲养肠道菌群的组成和群落结构(β多样性)有显著性差异。因此,室内饲养鼠兔不能有效反映野生状态下高原鼠兔肠道菌群的情况。
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| 关 键 词： | 高原鼠兔 微生物 16S rRNA 高通量测序 操作分类单元 群落结构 青藏高原 |
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