| 无瓣海桑根响应盐胁迫的转录组分析 |
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| 引用本文： | 梁锐涛,韩维栋,杨少瑕,陈蓓蓓.无瓣海桑根响应盐胁迫的转录组分析[J].林业科学研究,2023(1):68-78. |
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| 作者姓名： | 梁锐涛 韩维栋 杨少瑕 陈蓓蓓 |
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| 作者单位： | 广东海洋大学滨海农业学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31901330）；;广东海洋大学科研启动费资助项目（R19047）； |
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| 摘 要： | 目的]初步探究无瓣海桑的耐盐分子机制，筛选出无瓣海桑抗盐候选基因，为后续功能验证实验及林木抗盐性遗传育种奠定分子基础。方法]以1年生无瓣海桑幼苗为材料，用500 mmol·L-1 NaCl分别处理0 d(对照组)和10 d(处理组)，取不同条件下的根部组织进行转录组测序，并结合三代全长转录组数据进行后续生物信息学分析。结果](1)与对照组相比，NaCl处理10 d后，无瓣海桑幼苗根系中共有14 401个差异表达基因，其中，7 153个上调，7 248个下调。(2)GO分析发现，共有11 068个差异基因在47个GO条目得到注释。(3)在KEGG富集分析中，共有6 189个差异基因富集到134条通路，其中，共有14条通路显著富集(P值<0.01,Q值<0.05)。(4)通过进一步对差异基因进行功能注释分析，共筛选出抗盐候选基因89个，其中，抗氧化基因24个，渗透调节物质基因22个，植物激素基因19个，蛋白激酶基因10个，转录因子基因14个。结论]活性氧清除、渗透调节、植物激素、蛋白激酶及转录因子相关基因参与调控无瓣海桑盐逆境适应过程。
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| 关 键 词： | 无瓣海桑 盐胁迫 转录组 差异表达基因 |
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