| 青稞B组醇溶蛋白基因5'上游调控区的TAIL-PCR克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 韩兆雪,吴芳,赵桃,杨凡,钱刚,余懋群.青稞B组醇溶蛋白基因5''上游调控区的TAIL-PCR克隆及序列分析[J].麦类作物学报,2007,27(4):613-618. |
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| 作者姓名： | 韩兆雪 吴芳 赵桃 杨凡 钱刚 余懋群 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院成都生物研究所,四川成都,610041;中国科学院研究生院,北京,100039
2. 中国科学院成都生物研究所,四川成都,610041 |
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| 基金项目： | 科技部基础性工作项目
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国家科技支撑计划农作物种质资源项目
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中国科学院知识创新计划项目 |
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| 摘 要： | 为了阐明青稞种子中B组醇溶蛋白合成的遗传调控机制,为分子改良大麦和小麦籽粒品质奠定基础,以青稞品种Z09和Z26的基因组DNA为模板,根据已克隆的青稞B组醇溶蛋白(B-hordein)基因的5'端序列设计三个基因特异的反向引物,分别与随机简并引物配对,进行热不对称嵌套PCR(Thermal asymmetric interlaced PCR,TAIL-PCR)扩增,从两份西藏青稞材料中分离克隆出2个B-hordein基因的上游调控序列.序列测定结果表明,两个扩增片段长度分别为395和396 bp,加上已知B-hordein基因中的GSP2引物序列与翻译起始密码子之间198 bp的长度,则可得到约600 bp的B-hordein基因5'上游调控序列.将所得序列与Genbank中的三个贮藏蛋白基因的对应区段进行序列比对,所得序列与来自野生智利大麦(H.chilense)的B3-hordein基因(Genbank登录号:AY998010)、普通小麦(T.aestivum)的低分子量麦谷蛋白亚基基因(Genbank登录号:X07747)和栽培大麦(H.vulgare)的B-hordein基因(Genbank登录号:X03103)具有81%～95%的序列相似性.推测其TATA box位于-80 bp,CAAT-like box位于-140 bp处.另外,在-300 bp处存在一个胚乳盒(Endosperm Box,EB),包含EM基序和GCN4基序.EM基序高度保守,GCN4基序有一个核苷酸位点的突变.此外,在约-560 bp处存在一个胚乳盒类似结构.
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| 关 键 词： | 青稞 B-hordein基因 上游调控序列 TAIL-PCR 序列分析 青稞 醇溶蛋白基因 上游调控区 克隆 序列分析 Gene Cloning Sequence Analysis Highland Barley 结构 突变 酸位 核苷 高度 基序 Endosperm 胚乳 存在 序列相似性 vulgare |
| 文章编号： | 1009-1041(2007)04-0613-06 |
| 修稿时间： | 2007年3月20日 |
Cloning of B-hordein Gene 5' Upstream Regulation Sequence in Highland Barley and Sequence Analysis |
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| HAN Zhao-xue,WU Fang,ZHAO Tao,YANG Fan,QIAN Gang,YU Mao-qun.Cloning of B-hordein Gene 5'' Upstream Regulation Sequence in Highland Barley and Sequence Analysis[J].Journal of Triticeae Crops,2007,27(4):613-618. |
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| Authors: | HAN Zhao-xue WU Fang ZHAO Tao YANG Fan QIAN Gang YU Mao-qun |
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| Keywords: | |
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