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椰子基因组DNA的提取及SSR反应体系的优化
作者姓名:吴翼  武耀廷  马子龙
作者单位:[1]中国热带农业科学院椰子研究所,海南文昌571339 [2]中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口571101
摘    要:以马哇、文椰78F1和海南高种为试材,利用改良的CTAB法提取的基因组DNA纯度高,完整性好。将PCR体系的主要成分设定5个梯度,根据每个成分的变化引起的PCR-SSR的效果差异,探讨了椰子SSR技术中PCR体系的主要成分对扩增结果的影响,并对引物co007的适宜退火温度进行优化。最终确定了引物co007的最适退火温度为46.4~54℃,20μlPCR反应体系的最佳条件为:Mg2+浓度为2.0~4.0mmol/L,dNTPs的浓度为0.1~0.25mmol/L,Taq聚合酶用量为1.0~2.0U,引物浓度为0.5~2.0μmol/L。利用此反应体系对部分椰子品种进行PCR扩增并电泳检测,扩增结果清晰且有较高的多态性,表明该体系适合椰子的亲缘关系分析。

关 键 词:椰子  DNA提取  SSR  优化  椰子  基因组  提取  反应体系  优化  Coconut  System  Analysis  Optimization  Genomic  DNA  亲缘关系分析  多态性  电泳检测  品种  利用改良  用量  聚合酶  浓度  条件  最佳

Extraction of Genomic DNA and Optimization of SSR Analysis System in Coconut
Authors:Wu Yi  Wu Yaoting  Ma Zilong
Abstract:
Keywords:
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