| 小菜蛾性信息素结合蛋白与顺-9-十四碳烯酸酯 作用的分子模拟 |
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| 引用本文： | 赵奇,邓培渊,李玉华,杨玉珍,杨宗渠,雷志华.小菜蛾性信息素结合蛋白与顺-9-十四碳烯酸酯 作用的分子模拟[J].南方农业学报,2018,49(11):2193-2197. |
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| 作者姓名： | 赵奇 邓培渊 李玉华 杨玉珍 杨宗渠 雷志华 |
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| 作者单位： | 郑州师范学院 生命科学学院,郑州,450044郑州师范学院 郑州市生物物种资源研究重点实验室,郑州,450044 |
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| 摘 要： | 目的]研究小菜蛾性信息结合蛋白(PxylPBP2)与顺-9-十四碳烯酸酯(Z9-14:Ac)结合的分子动力学模式、结合内驱力及关键作用氨基酸,阐明二者识别的分子机制,为小菜蛾性诱剂的研发和小菜蛾防治提供参考依据.方法]运用YASARA对PxylPBP2进行同源建模,运用AutoDock 4.2进行PxylPBP2与Z9-14:Ac的空间结构对接,运用YASARA平台进行分子动力学模拟,运用MMPBSA.py模块计算PxylPBP2-Z9-14:Ac复合物的结合自由能,以Amber 12软件包描述结合关键氨基酸,分析PxylPBP2与Z9-14:Ac的结合模式及相互作用力.结果]同源建模构建了合理的PxylPBP2空间模型,分子对接结果表明Z9-14:Ac结合于PxylPBP2结合腔的内部,受体配体间无氢键,1.4 ns时对接复合物收敛平衡;PxylPBP2-Z9-14:Ac结合自由能为-9.76 kcal/mol;Phe22和Ile104的贡献能量和占总结合自由能的43%.结论]范德瓦斯力和非极性溶剂力是PxylPBP2与Z9-14:Ac形成稳定复合物的主要内驱力,能量贡献最大的两个关键氨基酸(Phe22和Ile104)位于侧链上.
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| 关 键 词： | 小菜蛾 性信息素结合蛋白(PxylPBP2) 性信息素 分子动力学模拟 能量分解 |
Molecular simulation of interactions between sex pheromone binding proteins and cis-9-tetradecenoic acid ester in Plutella xylostella |
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| ZHAO Qi,DENG Pei-yuan,LI Yu-hua,YANG Yu-zhen,YANG Zong-qu,LEI Zhi-hua.Molecular simulation of interactions between sex pheromone binding proteins and cis-9-tetradecenoic acid ester in Plutella xylostella[J].Journal of Southern Agriculture,2018,49(11):2193-2197. |
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| Authors: | ZHAO Qi DENG Pei-yuan LI Yu-hua YANG Yu-zhen YANG Zong-qu LEI Zhi-hua |
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