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家稗丙酮酸磷酸双激酶序列分析及三维结构建模
作者姓名:陈卫国  杨进文  王继亮  王金明
作者单位:山西农业大学生命科学学院 太谷030801(陈卫国),山西农业大学农学院 太谷030801(杨进文,王继亮,王金明)
基金项目:山西省研究生教育创新项目
摘    要:【研究目的】目前已从许多种植物中克隆了其PPDK基因,但是对于其蛋白结构的分析尚未报道,此文通过生物信息学方法对家稗PPDK的序列进行了分析,并对其三维结构进行了建模分析;【研究方法】利用DNASTAR、Vector NTI 9、SignalP等生物信息学平台对Echinochloa crusgalli var frumentacea(Roxb.)W.F.Wight]丙酮酸磷酸双激酶(Pyruvate orthophosphate dikinase)进行了序列分析和三维结构建模;【研究结果】家稗丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)同来自于高等植物的PPDK具有较高的同源性,无信号肽,存在17个跨膜结构区,二级结构是由许多螺旋、转角和少量折叠构成。同时在一二级结构分析的基础上,利用同源建模的方法完成了三维结构的建模。【结论】家稗PPDK蛋白同来自高等植物中的更为相近,无信号肽,有17个跨膜结构区,其三维结构为一同源四聚体。

关 键 词:序列分析  丙酮酸磷酸双激酶  三维结构同源建模  家稗

Sequence Analysis and Three-dimensional Structure modeling of Pyruvate Orthophosphate Dikinase from Echinochloa crusgalli var frumentacea(Roxb.)W.F.Wight
Authors:Chen Weiguo  Yang Jinwen  Wang Jiliang  Wang Jinming
Institution:(1College of life Sciences,Shanxi Agriculture University, Taigu 030801; 2College of Agronomy,Shanxi Agriculture University, Taigu 030801 )
Abstract:
Keywords:Sequence Analysis  Pyruvate orthophosphate dikinase  Homology Modeling  [Echinochloa crusgalli var frumentacea(Roxb  )W  F  Wight]
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