家稗丙酮酸磷酸双激酶序列分析及三维结构建模 |
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作者姓名: | 陈卫国 杨进文 王继亮 王金明 |
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作者单位: | 山西农业大学生命科学学院 太谷030801(陈卫国),山西农业大学农学院 太谷030801(杨进文,王继亮,王金明) |
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基金项目: | 山西省研究生教育创新项目 |
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摘 要: | 【研究目的】目前已从许多种植物中克隆了其PPDK基因,但是对于其蛋白结构的分析尚未报道,此文通过生物信息学方法对家稗PPDK的序列进行了分析,并对其三维结构进行了建模分析;【研究方法】利用DNASTAR、Vector NTI 9、SignalP等生物信息学平台对Echinochloa crusgalli var frumentacea(Roxb.)W.F.Wight]丙酮酸磷酸双激酶(Pyruvate orthophosphate dikinase)进行了序列分析和三维结构建模;【研究结果】家稗丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)同来自于高等植物的PPDK具有较高的同源性,无信号肽,存在17个跨膜结构区,二级结构是由许多螺旋、转角和少量折叠构成。同时在一二级结构分析的基础上,利用同源建模的方法完成了三维结构的建模。【结论】家稗PPDK蛋白同来自高等植物中的更为相近,无信号肽,有17个跨膜结构区,其三维结构为一同源四聚体。
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关 键 词: | 序列分析 丙酮酸磷酸双激酶 三维结构同源建模 家稗 |
Sequence Analysis and Three-dimensional Structure modeling of Pyruvate Orthophosphate Dikinase from Echinochloa crusgalli var frumentacea(Roxb.)W.F.Wight |
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Authors: | Chen Weiguo Yang Jinwen Wang Jiliang Wang Jinming |
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Institution: | (1College of life Sciences,Shanxi Agriculture University, Taigu 030801;
2College of Agronomy,Shanxi Agriculture University, Taigu 030801 ) |
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Abstract: | |
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Keywords: | Sequence Analysis Pyruvate orthophosphate dikinase Homology Modeling [Echinochloa crusgalli var frumentacea(Roxb )W F Wight] |
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