| 基于RNA-seq技术分析野生大麦穗部发育基因的表达谱及其转录动态 |
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| 引用本文： | 霍福临,熊祝佩,陈丽琴,聂小军,宋卫宁.基于RNA-seq技术分析野生大麦穗部发育基因的表达谱及其转录动态[J].麦类作物学报,2022(6):649-658. |
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| 作者姓名： | 霍福临 熊祝佩 陈丽琴 聂小军 宋卫宁 |
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| 作者单位： | (西北农林科技大学农学院，陕西杨凌 712100) |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31571647） |
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| 摘 要： | 为明确野生大麦穗部发育过程中基因表达的动态变化，以来自以色列的野生大麦Mehula 1-2为材料，对其在穗部发育的4个关键时期（开花后3、8、13和18 d)进行RNA-seq分析，并与栽培大麦穗部的基因表达谱进行了比较。结果表明，在野生大麦穗发育的4个时间点共鉴定到17 163个基因，其中11 273个为差异表达基因，包括635个转录因子相关基因；功能富集分析表明，这些差异基因主要富集到物质合成、代谢过程、物质运输、抗逆等相关过程或通路上；野生大麦和栽培大麦穗部基因的表达谱比较分析发现，两者共同表达的基因显著富集到细胞器、催化、代谢、调节及抗逆等相关通路上，而在特异表达基因方面，栽培大麦主要集中于甲基转移酶、次生壁生物合成、核糖体蛋白等相关基因，野生大麦主要集中于逆境抗性、花青素合成、钙调蛋白等相关基因。本研究发掘的与穗部发育相关的关键基因，丰富了大麦穗部遗传改良基因资源，为进一步解析野生大麦穗部发育关键基因的表达特性和调控机制奠定了基础。
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| 关 键 词： | 野生大麦 穗 转录组学 基因表达 转录动态 |
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