| 巴西橡胶树CCaMK基因家族成员的鉴定和表达分析 |
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| 引用本文： | 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,秦云霞,黄亚成,唐朝荣.巴西橡胶树CCaMK基因家族成员的鉴定和表达分析[J].热带农业科学,2016(12):16-20. |
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| 作者姓名： | 肖小虎 隋金蕾 戚继艳 秦云霞 黄亚成 唐朝荣 |
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| 作者单位： | 1. 中国热带农业科学院橡胶研究所 海南儋州 571737;2. 中国热带农业科学院橡胶研究所 海南儋州 571737; 海南大学农学院 海南海口 570228 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(No.31400565)。 |
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| 摘 要： | 钙/钙调素依赖型蛋白激酶(CCa MK,calcium-and calmodulin-dependent protein kinase)是一种钙离子结合蛋白,在钙信号传导过程中起重要作用。本研究以已发表的CCa MK序列作为检索序列,对橡胶树和其他5种植物(木薯、水稻、杨树、蓖麻和拟南芥)的基因组和转录组数据进行全面搜索,鉴定得到6个CCa MK基因,其中包括一个橡胶树CCa MK基因,命名为Hb CCa MK1。序列分析发现:5种植物的CCa MK氨基酸序列同源性较高,为73%~94%。基因结构分析发现,Hb CCa MK1和所分析的其他植物CCa MK一样均,含有6个内含子、1个蛋白激酶结构域和3个EF-hand结构域;从结构和进化上看,Hb CCa MK1和蓖麻、木薯2种植物的CCa MK具有较近的亲缘关系;在表达方面,Hb CCa MK1在橡胶树根中表达丰度最高,其次为树叶和花;另外,Hb CCa MK1的表达还与叶片发育、真菌侵染和低温胁迫有关。
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| 关 键 词： | 巴西橡胶树 CCaMK 基因家族 结构与进化 表达分析 |
Identification and expression analysis of CCaMK Gene from Hevea brasiliensis |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hevea brasiliensis CCaMK gene family structure and evolution expression analysis |
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