| 半滑舌鳎lnc-XR_003049606.1及其靶基因pmelb在无眼侧皮肤黑化过程中的表达 |
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| 引用本文： | 胡元日,杨倩,王佳林,李仰真,许岩岩,崔忠凯,程鹏,陈松林.半滑舌鳎lnc-XR_003049606.1及其靶基因pmelb在无眼侧皮肤黑化过程中的表达[J].水产学报,2022,46(4):529-536. |
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| 作者姓名： | 胡元日 杨倩 王佳林 李仰真 许岩岩 崔忠凯 程鹏 陈松林 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学水产与生命学院,中国水产科学研究院黄海水产研究所,中国水产科学研究院黄海水产研究所,中国水产科学研究院黄海水产研究所,唐山市农业科学研究院,中国水产科学研究院黄海水产研究所,中国水产科学研究院黄海水产研究所,中国水产科学研究院黄海水产研究所 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31702333），中国水产科学研究院创新团队项目（2020TD20），海水鱼产业技术体系半滑舌鳎岗位项目（CARS-47-G03），山东省泰山学者攀登计划项目，中国水产科学研究院基本科研业务费（2020XT0101） |
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| 摘 要： | 为探究人工养殖半滑舌鳎无眼侧皮肤经常出现黑化现象的成因，实验根据本课题组前期全转录组数据分析结果预测得出lnc-XR＿003049606.1与pmelb在基因层面上存在反式调控的关系。在半滑舌鳎无眼侧黑化皮肤中克隆获得pmelb的c DNA序列。生物信息学分析结果显示，pmelb的c DNA序列全长1 755 bp，编码584个氨基酸，其预测的蛋白分子量为63.94 ku，理论等电点为5.12，预测的二级蛋白结构含有1个Pleckstrin同源域、1个布鲁顿酪氨酸激酶富胱氨酸基序、1个Src同源3域、1个Src同源2域和1个酪氨酸激酶催化结构域。系统进化树分析显示，pmelb与其他鱼类对应的基因聚为一支。氨基酸同源性分析显示，半滑舌鳎的pmelb与大菱鲆和牙鲆的相似性最高(分别为68.05%和66.28%)。分别通过分析半滑舌鳎lnc-XR＿003049606.1和pmelb的表达分析发现，lnc-XR＿003049606.1在1龄半滑舌鳎的皮肤和肝脏中表达，皮肤中表达量在60 d达到顶峰，随着时间延长而降低；而pmelb则主要在皮肤中表达，表达量在时间线上先升高再降低。本研究初步探究...
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| 关 键 词： | 半滑舌鳎 lncRNA pmelb 体色 黑化 |
| 收稿时间： | 2021/11/15 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/12/15 0:00:00 |
Expression analysis of LNC-XR_003049606-1 and its target gene pmelb in blind side skin melanization in Cynoglossus semilaevis |
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| HU Yuanri,YANG Qian,WANG Jialin,LI Yangzhen,XU Yanyan,CUI Zhongkai,CHENG Peng,CHEN Songlin.Expression analysis of LNC-XR_003049606-1 and its target gene pmelb in blind side skin melanization in Cynoglossus semilaevis[J].Journal of Fisheries of China,2022,46(4):529-536. |
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| Authors: | HU Yuanri YANG Qian WANG Jialin LI Yangzhen XU Yanyan CUI Zhongkai CHENG Peng CHEN Songlin |
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| Institution: | School of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University,,,,,,,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cynoglossus semilaevis lncRNA pmelb body color hypermelanosis |
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