东北地区不同宿主NDV的分离鉴定与系统发育进化分析 |
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引用本文: | 刘文斌,崔尚金,李秀云,刘立奎,张洪英.东北地区不同宿主NDV的分离鉴定与系统发育进化分析[J].畜禽业,2006(1):26-30. |
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作者姓名: | 刘文斌 崔尚金 李秀云 刘立奎 张洪英 |
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作者单位: | [1]中国农科院哈尔滨兽医研究所疫病诊断与流行病学中心,黑龙江哈尔滨150001 [2]长春市畜禽防疫工作总站,黑龙江哈尔滨150001 |
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摘 要: | 针对我国东北地区获得高免新城疫(Newcastle Disease,ND)抗体鸡群仍然发生新城疲(ND)的情况,应用分子流行病学技术。对所分离的18株鸡菲新城疲病毒(Newcastle Disease Virus,NDV)和1株鸽源NDV进行系统发育进化分析。将NDV分离株通过差速离心纯化.以SDS-蛋白酶K(或Trizol法)提取病毒RNA,RT—PCR扩增其融合蛋白(F)基因532bp或280bp关键片断,经回收克隆到pMD 18-T载体上进行核苷酸序列测定(GenBank序列号:AY208680-AY208698)。核苷酸和氧基酸序列进行同源性比较,结果表明各毒株之间核苷酸同源性为83.1%-100%,氨基酸同源性为85.5%-100%;系统发育进化时分析显示.其中JL-12、HLJ-3为弱毒株.与疫苗株V4同属于基因Ⅰ型;其余17株均为强毒袜.其中HLJ-4、JL-14为Ⅵ型,其余15株均为基因Ⅶ型,由此可见东北地区目前新城疲的流行是由3种不同基因型的NDV毒珠(Ⅰ型、Ⅵ型、Ⅶ型)所发.但以基因Ⅶ型为主.速与我国其他地区和世界上其他国家ND的流行情况趋于一致。
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关 键 词: | NDV F基因 分子流行病学 系统发育进化树 |
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