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广灵驴ADD1基因的克隆和序列分析与组织表达
引用本文:李武峰,孙瑜彤,赵婧微,李树军.广灵驴ADD1基因的克隆和序列分析与组织表达[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2020,46(6):733-741.
作者姓名:李武峰  孙瑜彤  赵婧微  李树军
作者单位:山西农业大学生命科学院,山西太谷 030801;繁峙县动物疫病预防控制中心,山西繁峙 034300
基金项目:山西省重点研发计划(指南)项目(201803D421022)
摘    要:运用RT–PCR方法,克隆广灵驴的ADD1基因的CDS区,对其进行序列分析,并通过qRT–PCR技术鉴定ADD1基因在广灵驴心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和背最长肌中的相对表达水平。结果表明:广灵驴ADD1基因完整的CDS序列全长为2 223 bp,可编码740个氨基酸,序列已提交到NCBI,登录号为MN_166472,其核苷酸序列与马的核苷酸序列的同源性最高,达99.6%;生物信息学预测ADD1蛋白为结构稳定的亲水性蛋白,理论等电点为5.58,二级结构主要以α–螺旋和无规则卷曲为主,存在1个Ⅱ类醛缩酶和内收蛋白N端超家族结构域,该蛋白没有信号肽及跨膜区域,主要定位在细胞核中,序列中共存在88个磷酸化位点,69个O–糖基化位点和3个N–糖基化位点;实时荧光定量检测结果表明,ADD1基因在广灵驴的6种组织中均有表达,但存在差异,在背最长肌中表达量最丰富,在肝脏中表达量最低。

关 键 词:广灵驴  ADD1基因  克隆  生物信息学分析  差异表达
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