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红鳍东方鲀gsdf基因的克隆及表达模式分析
引用本文:闫红伟,田雨顺,姜丽楠,王连顺,刘洋,刘奇,刘圣聪.红鳍东方鲀gsdf基因的克隆及表达模式分析[J].大连海洋大学学报,2016(2):140-146.
作者姓名:闫红伟  田雨顺  姜丽楠  王连顺  刘洋  刘奇  刘圣聪
作者单位:1. 大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连,116023;2. 大连海洋大学辽宁省海洋牧场工程技术研究中心,辽宁大连,116023;3. 大连天正实业有限公司,辽宁 大连,116000
基金项目:辽宁省博士启动基金资助项目(20141105),教育部留学回国人员科研启动基金资助项目(2015-311),农业部北方海水增养殖重点实验室开放课题(2014-MSENC-KF-14)
摘    要:为研究红鳍东方鲀Takifugu rubripes的性别决定因子(gonadal soma derived factor,GSDF),利用c DNA末端快速扩增技术(RACE)首次克隆了红鳍东方鲀gsdf基因(Trgsdf)的c DNA全长序列(Gen Bank登陆号:KR914667)。结果表明:Trgsdf c DNA序列全长为1734 bp,其中5'端非编码区144 bp,开放阅读框648 bp,3'端非编码区942 bp,共编码215个氨基酸;预测的氨基酸序列中存在1个长度为19个氨基酸的信号肽和相同长度的跨膜区,1个N-糖基化位点NST,1个TGF-β家族成员特有的保守结构域;BLAST同源性分析结果显示,红鳍东方鲀GSDF氨基酸序列与其他鱼类的相似性为26%~58%;系统发育分析结果显示,鱼类GSDF单独聚为一支,与TGF-β超家族内的其他成员分开,红鳍东方鲀与青鳉Oryzias latipes GSDF的亲缘关系最近,先聚为一支,后与三斑海猪鱼Halichoeres trimaculatus聚在一起,与矛尾鱼Latimeria menadoensis的GSDF亲缘关系最远;应用RT-PCR技术检测Trgsdf mRNA在雌性和雄性红鳍东方鲀成鱼不同组织中的表达,结果显示,Trgsdf mRNA在卵巢和精巢中高表达,在皮肤和肌肉组织中微量表达,在其他组织中无表达;采用相对实时荧光定量PCR方法比较了成鱼卵巢和精巢中Trgsdf mRNA的表达量,结果显示,Trgsdf mRNA在精巢中的表达量显著高于卵巢(P0.05),约为卵巢表达量的6倍。研究表明,gsdf基因可能在红鳍东方鲀的性腺尤其是精巢的分化和发育过程中起着重要的作用。

关 键 词:红鳍东方鲀  性别决定因子  cDNA末端快速扩增技术  实时荧光定量PCR  基因表达

Cloning and expression profiling of the gsdf gene in redfin puffer Takifugu rubripes
Abstract:
Keywords:Takifugu rubripes  gonadal soma derived factor(GSDF)  RACE  Real-Time PCR  gene expression
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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