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番茄HDACs家族基因在胁迫条件下的表达分析
引用本文:李涛,苏慧慧,李植良,徐小万,王恒明,李颖,黎振兴.番茄HDACs家族基因在胁迫条件下的表达分析[J].热带作物学报,2015,36(11):1994-2001.
作者姓名:李涛  苏慧慧  李植良  徐小万  王恒明  李颖  黎振兴
作者单位:1 广东省农业科学院蔬菜研究所 2 广东省蔬菜新技术研究重点实验室;1 广东省农业科学院蔬菜研究所 2 广东省蔬菜新技术研究重点实验室;广东省农业科学院蔬菜研究所;1 广东省农业科学院蔬菜研究所 2 广东省蔬菜新技术研究重点实验室;广东省农业科学院蔬菜研究所;广东省农业科学院蔬菜研究所;广东省农业科学院蔬菜研究所
基金项目:国家自然科学基金(No. 31301776);广东省农业科学院院长基金项目(No. 201303);蔬菜研究所所长基金项目(No. 201502);农业部现代产业体系项目(No. CARS-25-G-36);广东省省级科技计划项目(No. 2014A020208044;No. 2015A030302040;No. 2015B090906012);广东省对外科技合作项目(No. 2013B050800012);广东省科技厅条件建设项目(No. 粤财教[2013]112号)。
摘    要:组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDACs)家族基因在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用。利用生物信息学方法对番茄的HDACs家族成员、分布及结构和功能等进行分析。结果表明,番茄HDACs家族包含15个成员,分为3个亚家族。遗传进化分析表明,番茄HDACs家族成员与拟南芥HDACs家族具有相似分类。利用实时荧光定量PCR对番茄HDACs家族基因的组织表达分析表明,HDACs具有组织特异性表达差异,SlHDT1、SlHDT2和SlHDT3在根中表达较高,而SlHDA1、SlHDA3、SlHDA5、SlHDA6在果实发育过程中表达较高;利用RT-PCR对番茄HDACs的胁迫响应分析表明,在盐、SA、ABA、高温和低温胁迫条件下,15个番茄HDACs成员的表达模式不同,其中部分基因的表达水平被显著地诱导增加或者降低,推测这些基因很可能参与了调控番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应。结果将为进一步解析番茄HDACs家族基因的功能奠定基础。

关 键 词:番茄  组蛋白去乙酰化酶  表达分析  氧化胁迫  青枯病

Genome-wide Identification and Expression Analysis in Biotic and Abiotic Stress of HDACs Gene Family in Tomato
LI Tao,SU Huihui,LI Zhiliang,XU Xiaowan,WANG Hengming,LI Ying and LI Zhenxing.Genome-wide Identification and Expression Analysis in Biotic and Abiotic Stress of HDACs Gene Family in Tomato[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2015,36(11):1994-2001.
Authors:LI Tao  SU Huihui  LI Zhiliang  XU Xiaowan  WANG Hengming  LI Ying and LI Zhenxing
Institution:1 Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences 2 Guangdong Key Laboratory for New Technology Research of Vegetables, Guangzhou;1 Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences 2 Guangdong Key Laboratory for New Technology Research of Vegetables, Guangzhou;Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences;1 Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences 2 Guangdong Key Laboratory for New Technology Research of Vegetables, Guangzhou;Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences;Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences;Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences
Abstract:
Keywords:Tomato  Histone deacetylation  Gene expression  Oxidative stress  Bacterial wilt
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