| 利用InDel标记分析23份黄瓜种质的遗传多样性及核心种质资源筛选 |
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| 引用本文： | 张红梅,翟文,金海军,丁小涛,余纪柱.利用InDel标记分析23份黄瓜种质的遗传多样性及核心种质资源筛选[J].上海农业学报,2019(4). |
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| 作者姓名： | 张红梅 翟文 金海军 丁小涛 余纪柱 |
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| 作者单位： | 上海市农业科学院设施园艺研究所上海市设施园艺技术重点实验室;东华理工大学化学生物与材料科学学院 |
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| 摘 要： | 为了研究不同来源黄瓜的亲缘关系,筛选适宜作杂交亲本的种质资源,基于黄瓜重测序开发的InDel标记,应用UPGMA进化树聚类、主成分分析和群体遗传结构分析3种方法分析了23份黄瓜种质的遗传多样性。结果表明:23份黄瓜种质的遗传相似性系数为0. 23—0. 95,平均值为0. 56,相似性系数低于0. 6的有137对组合,占全部组合的54%,说明这些材料的遗传多样性较好。3种分析方法均将23份黄瓜种质分为三大类群:P1来源于亚洲,都属于华南类型黄瓜; P2来源于欧洲和美国,包含欧洲类型长黄瓜、欧洲类型短黄瓜和2个美国加工型黄瓜; P3仅包含1个来源于广东的品种,从表型上看属于华南类型。P3亲缘关系更接近P1,P1和P2之间遗传差异明显。利用InDel标记分析的结果,对核心种质最佳样本量进行了预测,应用M策略将9份黄瓜种质确定为核心种质,包含了群体中几乎所有的黄瓜类型,外形上有白刺、褐刺以及光滑型,这9份核心种质能够很大范围地覆盖表型的变异。
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