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罗非鱼 MC4R 基因克隆及与其生长相关的 SNPs 位点
引用本文:刘福平,白俊杰,叶星,李胜杰,李小慧,于凌云.罗非鱼 MC4R 基因克隆及与其生长相关的 SNPs 位点[J].中国水产科学,2009,6(6).
作者姓名:刘福平  白俊杰  叶星  李胜杰  李小慧  于凌云
作者单位:1. 中国水产科学研究院,珠江水产研究所,中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州510380;上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306
2. 中国水产科学研究院,珠江水产研究所,中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州510380
基金项目:农业部"948"项目,国家"十一五"科技支撑计划项目,国家科技基础条件平台工作项目 
摘    要:黑素皮质素受体-4(Melanocortin receptor-4,MC4R)是5种已发现的黑素皮质素受体家族成员之一,属于跨膜G-蛋白耦联受体超级家族,对于调节动物的采食量、体质量及能最稳态有着重要的作用.本研究采用基因组步移技术获得了尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)MC4R基因组DNA序列.该基因全长2547 hp,其中5'侧翼序列长为1481 bp,3'侧翼序列长为82 bp,编码区序列长为984 bp,只有1个外显子.采用PCR产物直接测序法、PCR-RFL和CRS-PCR技术对尼罗罗非鱼MC4R基因启动子和外显子区域进行了SNPs位点的检测和分犁,结果共检测到5个SNPs位点(-G1000C、-T974A、C276T、C561T和C708T),其中外显子上的3个SNPs位点均为同义突变.利用一般线性模型分析5个SNPs位点与尼罗罗非鱼生长性状的关系,结果表明,5个SNPs位点不同基因型之间体质量均值差异最大值分别为9.5%、23.2%、14.4%、18.6%和13.5%,没有达到显著水平(P>0.05).将5个SNPs位点不同基因型组合成7种双倍型(去掉频率小于3%的组合),关联分析表明,在体质量和体长这2个主要生长性状方面,双倍型D4与D1、D3、D6存在显著性差异(P<0.05),双倍型D2与D3、D6也存在显著性差异(P<0.05).因而可以考虑将MC4R基因作为影响罗非鱼体质量等生长性状的候选基因,应用于罗非鱼分子标记辅助育种.

关 键 词:尼罗罗非鱼  双倍型  关联分析

Cloning of MC4R gene and study on the association between SNPs of MC4R and growth trait in tilapia (Oreochromis niloticus)
LIU Fu-ping,BAI Jun-jie,YE Xing,LI Sheng-jie,LI Xiao-hui,YU Ling-yun.Cloning of MC4R gene and study on the association between SNPs of MC4R and growth trait in tilapia (Oreochromis niloticus)[J].Journal of Fishery Sciences of China,2009,6(6).
Authors:LIU Fu-ping  BAI Jun-jie  YE Xing  LI Sheng-jie  LI Xiao-hui  YU Ling-yun
Abstract:
Keywords:MC4R  SNPs
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