| 拟态弧菌安徽分离株外膜蛋白基因OmpU的克隆测序与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李小飞,李槿年,张传亮,余为一.拟态弧菌安徽分离株外膜蛋白基因OmpU的克隆测序与生物信息学分析[J].水利渔业,2007,27(3):13-16. |
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| 作者姓名： | 李小飞 李槿年 张传亮 余为一 |
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| 作者单位： | 安徽农业大学动物科技学院,合肥,230036 |
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| 基金项目： | 安徽省高校优秀人才项目;安徽省教育厅科研项目;安徽省自然科学基金 |
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| 摘 要： | 测序结果显示4株拟态弧菌OmpU基因片段长为849~876bp,编码283~292个氨基酸;拟态弧菌HX4分离株OmpU基因ORF长1 038 bp,编码346个氨基酸。生物信息学分析结果显示,OmpU基因在拟态弧菌安徽分离株之间及其与霍乱弧菌参考株间均具有较高保守性,彼此间核苷酸同源性和氨基酸同源性分别介于82.8%~99.6%和83.3%~100%;拟态弧菌OmpU蛋白N端前22个氨基酸组成信号肽,N末端有1个明显疏水区,并含有多个蛋白激酶磷酸化位点和糖基化位点;OmpU蛋白含有2个明显跨膜域,二级结构中富含β-折叠结构,在蛋白的53~66 aa、185~192 aa、215~219 aa和275~281 aa之间可能存在抗原表位。
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| 关 键 词： | 拟态弧菌 OmpU基因 克隆测序 生物信息学分析 |
| 文章编号： | 1003-1278（2007）03-0013-04 |
| 修稿时间： | 2006-08-02 |
The outer membrane protein gene sequence of Vibrio mimicus and bioinformatics analysis |
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| LI Xiao-fei.The outer membrane protein gene sequence of Vibrio mimicus and bioinformatics analysis[J].Reservoir Fisheries,2007,27(3):13-16. |
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| Authors: | LI Xiao-fei |
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| Abstract: | |
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