2020—2022年玉溪市猪流行性腹泻病毒分子流行病学调查及遗传进化分析 |
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引用本文: | 朱鹤然,赵国洪,赵碧,王帅,赵津.2020—2022年玉溪市猪流行性腹泻病毒分子流行病学调查及遗传进化分析[J].云南畜牧兽医,2023(3):1-4. |
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作者姓名: | 朱鹤然 赵国洪 赵碧 王帅 赵津 |
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作者单位: | 1. 云南省畜牧兽医科学院;2. 玉溪农业职业技术学院;3. 云南省农业科学院;4. 云南农业大学 |
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摘 要: | 为了解近年玉溪市猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)流行及遗传进化情况,本研究采集了2020—2022年间玉溪市4个养猪场的临床腹泻样品33份,采用RT-qPCR方法调查PEDV的流行情况,再用RT-PCR方法扩增PEDV阳性样品的M基因,分析病毒的遗传进化。流行病学调查结果显示,33份腹泻样品中,RT-qPCR检测PEDV阳性率为39.39%(13/33)。PCR扩增13份阳性cDNA样品M基因,测序结果证实为PEDV M基因片段。基于M基因遗传进化分析结果显示,玉溪市猪群流行的PEDV均属于基因2型,与其他代表毒株基因同源性为97.06%~99.56%,氨基酸同源性为96.48%~99.56%。结果表明,玉溪市PEDV以基因2型为主,提示需要选择更有效的疫苗来控制PEDV的流行。
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关 键 词: | 猪流行性腹泻病毒 M基因 流行病学调查 遗传进化 基因2型 |
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