辣椒全基因组中LBD转录因子的鉴定与表达分析 |
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引用本文: | 郑忠凡,张亚利,胡灿,戴雄泽,刘峰,袁祖华.辣椒全基因组中LBD转录因子的鉴定与表达分析[J].园艺学报,2016,43(4):683-694. |
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作者姓名: | 郑忠凡 张亚利 胡灿 戴雄泽 刘峰 袁祖华 |
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作者单位: | (1中南大学研究生院隆平分院,长沙 410125;2湖南省农业科学院蔬菜研究所,长沙 410125;3湖南中医药大学药学院,长沙 410125) |
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基金项目: | 国家科技支撑计划项目(2014BAD05B04),国家自然科学基金项目(31470105) |
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摘 要: | 利用生物信息学的方法,从辣椒基因组中鉴定出45个LBD基因,这些基因分布于辣椒9条染色体上。该家族成员内含子数整体上不超过3个,结构相对简单。进化关系显示辣椒LBD基因可分为ClassⅠ和ClassⅡ两大类,细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7个亚类。不同组织和发育时期的表达模式研究发现,该基因家族具有一定的时空表达特异性。qRT-PCR结果表明,热激胁迫可以明显激活或抑制部分LBD基因的表达,其中ClassⅡ类基因较ClassⅠ类对高温具有更高的敏感性。
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关 键 词: | 辣椒 LBD基因家族 进化分析 基因表达 |
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