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赤桉EcWRKY50转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析
引用本文:王鹏良,;韦翠娥,;覃柳辉,;杨利平,;张照远,;吴幼媚,;覃子海,;蔡玲,;黄金使,;高磊,;甘四明.赤桉EcWRKY50转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析[J].广西热带农业,2014(4):9-16.
作者姓名:王鹏良  ;韦翠娥  ;覃柳辉  ;杨利平  ;张照远  ;吴幼媚  ;覃子海  ;蔡玲  ;黄金使  ;高磊  ;甘四明
作者单位:[1]广西林业科学研究院,广西优良用材林资源培育重点实验室,南宁530002; [2] 广西国有三门江林场;,广西优良用材林资源培育重点实验室,南宁530002; [3]广西钦州市林业科学研究所 钦州市生物工程技术研究中心;,广西优良用材林资源培育重点实验室,南宁530002; [4]中国科学院武汉植物园;,广西优良用材林资源培育重点实验室,南宁530002; [5]中国林业科学研究院热带林业研究所 林木遗传育种国家重点实验室,广西优良用材林资源培育重点实验室,南宁530002;
基金项目:广西优良用材林资源培育重点实验室开放课题基金(12A0301); 国家高技术研究发展计划(863计划)课题(2013AA102705); 钦州市科学研究和技术开发项目(20137003)资助
摘    要:WRKY转录因子参与植物生长发育、抗病虫、耐逆境等众多过程,并在其中起重要作用。为了研究WRKY在赤桉中的结构和功能,本研究利用电子克隆的方法克隆了赤桉与AtWRKY50高度同源的一个WRKY基因EcWRKY50,并利用生物信息学方法对该基因编码蛋白的氨基酸组成,理化性质,亚细胞定位和高级结构等方面进行预测和分析。结果表明,EcWRKY50基因全长为585 bp,包含一个480 bp的开放阅读框,编码159个氨基酸,该基因蛋白分子量为18.187KD,理论等电点为5.45。该蛋白含有一个WRKYGKK的保守结构域和C2H2结构域,属于GroupⅡc成员,很可能在细胞质中起转录和转录调控的作用;并对该蛋白进行了同源性分析。这些研究为该基因功能的进一步分析奠定了坚实的基础。

关 键 词:赤桉  EcWRKY50转录因子  基因电子克隆  生物信息学分析
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