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| 猪附红细胞体ORF4蛋白的空间结构与B细胞抗原表位预测 | |
| 引用本文： | 单思,巴彩凤.猪附红细胞体ORF4蛋白的空间结构与B细胞抗原表位预测[J].中国农学通报,2012,28(32):63-67. |
| 作者姓名： | 单思 巴彩凤 |
| 作者单位： | 辽宁医学院实验动物中心,辽宁锦州,121001 |
| 基金项目： | 辽宁省科技基金资助"附红细胞体和出血性大肠杆菌感染BALB/c小鼠模型的建立及对免疫功能影响的研究" |
| 摘 要： | 为了预测猪附红细胞体(Mycoplasma suis)ORF4蛋白的空间结构和B细胞抗原表位。选择Genebank序列号AJ504999中ORF4基因，应用生物信息软件和互联网在线程序分析ORF4的氨基酸序列预测二级结构、三级结构、亲水性、柔韧性、抗原指数及表面可及性。结果表明：ORF4蛋白二级结构没有α-螺旋，其中柔性结构以β-转角为主，潜在的优势B细胞抗原表位区段主要分布在28~34，54~61氨基酸区段。本研究预测了ORF4蛋白空间结构和B细胞抗原表位，为猪附红细胞体表位疫苗的设计研发提供了指导意义。 |
| 关 键 词： | 长沙市 长沙市 |
| 收稿时间： | 2012/4/13 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2012/5/24 0:00:00 |
Prediction of the Spatial Structure and B-cell Epitopes of Mycoplasma suis ORF4 Protein |
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| Shan Si , Ba Caifeng.Prediction of the Spatial Structure and B-cell Epitopes of Mycoplasma suis ORF4 Protein[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2012,28(32):63-67. | |
| Authors: | Shan Si Ba Caifeng |
| Abstract: | To predict the spatial structure and B-cell epitopes of Mycoplasma suis ORF4 protein. The secondary structure, tertiary structure, hydrophilicity, flexible region, antigenic index and surface probability were predicted through the nucleotide sequence of AJ504999-ORF4 were analyzed by bioinformatics software and internet routine. The results showed that the potential B cell antigenic epitopes of Mycoplasma suis ORF4 protein were located at 28-34, 54-61aa, whose the secondary structure were without α-helix but rich in β-pleated sheet. Prediction of the spatial structure and B-cell epitopes of Mycoplasma suis ORF4 protein might laid the basis for studies of the design of epitopes vaccine. |
| Keywords: | forecast |
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