| 正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库构建及EST初步分析 |
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| 引用本文： | 李晓宁,孙石开,蔡新斌,杨坚,苏丽娟,章民,李晓泉,尹珊,李延生,罗廷荣.正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库构建及EST初步分析[J].广西农业科学,2011,42(7):791-797. |
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| 作者姓名： | 李晓宁 孙石开 蔡新斌 杨坚 苏丽娟 章民 李晓泉 尹珊 李延生 罗廷荣 |
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| 作者单位： | 广西大学动物科学技术学院,南宁,530005 |
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| 基金项目： | 国家“863”计划项目，国家自然科学基金项目，广西科学研究与技术开发计划项目，广西大学科学技术研究重点基金项目 |
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| 摘 要： | 【目的】构建猪淋巴细胞基因文库，初步绘制正常猪外周血淋巴细胞的基因表达谱，为进一步筛选免疫相关基因提供平台。【方法】以mRNA为模板，经反转录酶催化，在体外反转录成cDNA，与质粒载体连接后转化大肠杆菌，进一步扩增后，获得猪外周血淋巴细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合，并进行序列分析和注释。【结果】构建了正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库，获得库容量为1．2×10^6PFU／mL、重组率为93．3％、85％插入片段处于750～2000bp的高质量文库；随机测定1100条ESTs，经拼接和聚类，获得152条高表达的基因重叠群（Contigs）和619条低表达基因——单拷贝的EST（Singletons）；经序列比对分析，发现23．3％ESTs为与任何物种都没有匹配的新基因，75．9％ESTs为与猪没有匹配的新基因。用GO数据库对获得的EST进行基因功能分类和KEGG路径图分析，发现丝裂原活化蛋白激酶途径（Mitogenn—activated protein kinase，MAPK）、钙信号通路、胰岛素信号通路、脂肪细胞因子信号通路、Toll—like受体信号通路、B细胞受体信号通路和T细胞受体信号通路的基因均有较高表达。【结论】大部分的猪外周血淋巴细胞基因尚未被分离和鉴定出来，但这些基因mRNA转录和表达丰度均较高，且在猪外周血淋巴细胞中起着非常重要的作用。
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| 关 键 词： | 猪 外周血淋巴细胞 cDNA文库 表达序列标签（EST） |
Construction of cDNA library from normal swine peripheral blood lymphocytes and preliminary analysis of its ESTs |
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| LI Xiao-ning,SUN Shi-kai,CAI Xin-bin,YANG Jian,SU Li-juan,ZHANG Min,LI Xiao-quan,YIN Shan,LI Yan-sheng,LUO Ting-rong.Construction of cDNA library from normal swine peripheral blood lymphocytes and preliminary analysis of its ESTs[J].Guangxi Agricultural Sciences,2011,42(7):791-797. |
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| Authors: | LI Xiao-ning SUN Shi-kai CAI Xin-bin YANG Jian SU Li-juan ZHANG Min LI Xiao-quan YIN Shan LI Yan-sheng LUO Ting-rong |
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| Institution: | (College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning 530005, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | peripheral blood lymphocytes eDNA library expressed sequence tags （ESTs） |
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