山核桃SSR标记的初步开发 |
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引用本文: | 宋双,黄银芝,董雷鸣,黄有军,曾燕如,吴智敏.山核桃SSR标记的初步开发[J].浙江林学院学报,2012,29(4):626-633. |
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作者姓名: | 宋双 黄银芝 董雷鸣 黄有军 曾燕如 吴智敏 |
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作者单位: | 1. 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地,浙江临安,311300 2. 浙江省龙泉市林业局,浙江龙泉,323700 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(30771752);浙江省自然科学基金资助项目(Y306373);浙江农林大学研究生科研创新基金资助项目(2112010002) |
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摘 要: | 基于山核桃Carya cathayensis脂肪代谢相关cDNA文库的部分测序结果,发现43条cDNA序列具有简单重复序列(SSR)碱基重复特点,用Primer Premier 5设计了34对表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)引物;建立了适用于山核桃的SSR分析体系,并用设计的SSR引物对对天然群体山核桃40个样品进行了初步的应用性试验.结果表明:34对引物中有4对无扩增产物,3对引物的扩增产物超过了设计范围,27对引物在供试的40个山核桃材料中有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中有18对引物的扩增产生了22个多态性位点,占总扩增位点数的47.8%.将SSR标记分析结果与山核桃已有的显性标记分析结果进行比较,发现SSR标记多态性位点的比例较高,且能够区分显性纯合位点及显性杂合位点.结论:设计开发山核桃的EST-SSR标记是可行有效的.
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关 键 词: | 经济林学 EST-SSR 山核桃 cDNA文库 |
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